184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2458 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1369 aa  2651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.64 
 
 		 1066 aa  145  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.26 
 
 		 1769 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  26.39 
 
 		 994 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.27 
 
 		 1489 aa  125  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.67 
 
 		 816 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  26.68 
 
 		 939 aa  116  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  24.66 
 
 		 2848 aa  115  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  29.21 
 
 		 1012 aa  106  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.96 
 
 		 1242 aa  106  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  25.87 
 
 		 1119 aa  104  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  27.21 
 
 		 972 aa  104  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  25.65 
 
 		 1152 aa  102  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.01 
 
 		 774 aa  99  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  24.23 
 
 		 985 aa  98.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  27.7 
 
 		 1886 aa  97.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  26.67 
 
 		 980 aa  95.5  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  24.34 
 
 		 995 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  25.65 
 
 		 759 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.13 
 
 		 763 aa  92.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1881 aa  92.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  24.41 
 
 		 1033 aa  92  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.37 
 
 		 919 aa  91.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  25.15 
 
 		 1068 aa  90.9  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  23.6 
 
 		 1782 aa  87.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  23.47 
 
 		 986 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.89 
 
 		 915 aa  85.5  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.34 
 
 		 913 aa  85.5  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  24.41 
 
 		 1028 aa  84.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  25.82 
 
 		 1001 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  25.34 
 
 		 882 aa  84.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  24.92 
 
 		 1550 aa  83.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  24.08 
 
 		 1004 aa  82.8  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.93 
 
 		 1227 aa  80.1  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  24.07 
 
 		 1156 aa  80.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  23.88 
 
 		 1179 aa  78.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  24.62 
 
 		 995 aa  78.2  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  25.17 
 
 		 1154 aa  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  24.3 
 
 		 991 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  22.84 
 
 		 728 aa  76.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  22.84 
 
 		 728 aa  77  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  22.84 
 
 		 728 aa  77  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.83 
 
 		 1134 aa  75.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  22.19 
 
 		 2407 aa  75.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  24 
 
 		 1519 aa  75.1  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  21.21 
 
 		 4248 aa  74.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  26.64 
 
 		 1025 aa  74.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.6 
 
 		 1048 aa  73.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.61 
 
 		 641 aa  74.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  22.6 
 
 		 831 aa  72.8  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  27.31 
 
 		 684 aa  72.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  22.84 
 
 		 3506 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2456  hypothetical protein  33.17 
 
 		 299 aa  71.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000324908  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  26.17 
 
 		 1459 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  24.53 
 
 		 1001 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  25.34 
 
 		 983 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  24.91 
 
 		 907 aa  69.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  21.71 
 
 		 814 aa  68.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  23.76 
 
 		 1078 aa  68.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  23.39 
 
 		 2003 aa  68.6  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.13 
 
 		 1081 aa  68.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  26.07 
 
 		 1222 aa  68.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  23.14 
 
 		 607 aa  67.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  25.94 
 
 		 1458 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1114  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.14 
 
 		 1358 aa  67.4  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0311  hypothetical protein  30.89 
 
 		 2342 aa  67  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  23.5 
 
 		 2083 aa  66.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  26.1 
 
 		 684 aa  65.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  22.16 
 
 		 1055 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  24.59 
 
 		 1019 aa  63.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.46 
 
 		 1011 aa  62.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  25.21 
 
 		 942 aa  63.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  24.91 
 
 		 909 aa  62  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  25.57 
 
 		 4238 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  22.09 
 
 		 650 aa  60.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1329  outer membrane autotransporter  23.41 
 
 		 1058 aa  61.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0892684  normal  0.563685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  24.5 
 
 		 1180 aa  60.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  23.44 
 
 		 1177 aa  60.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  26.82 
 
 		 647 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 		 730 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  22.45 
 
 		 1038 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  23.26 
 
 		 1129 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  23.26 
 
 		 1131 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.46 
 
 		 1322 aa  59.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  23.04 
 
 		 664 aa  59.3  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  24.64 
 
 		 1011 aa  59.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  22.75 
 
 		 860 aa  59.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  23.01 
 
 		 10429 aa  58.9  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  23.02 
 
 		 1130 aa  58.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  26.82 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  25.23 
 
 		 1672 aa  58.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1571 aa  58.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  27.49 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  23.08 
 
 		 1129 aa  58.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  26.61 
 
 		 594 aa  58.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.31 
 
 		 972 aa  58.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  23.08 
 
 		 1131 aa  58.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  23.08 
 
 		 1131 aa  58.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  22.28 
 
 		 723 aa  58.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.77 
 
 		 1673 aa  58.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>