146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1607 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  100 
 
 		 332 aa  690    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  33 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  32.44 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  32.44 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3150  amidohydrolase 2  32.06 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.992513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4553  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2796  hypothetical protein  32.76 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1504  amidohydrolase 2  32.33 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  32.12 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  32.48 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3634  putative amidohydrolase  28.4 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2642  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.25369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1377  amidohydrolase 2  32.76 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.895112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  31.06 
 
 		 286 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1956  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3496  amidohydrolase 2  28.63 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2287  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0025243  decreased coverage  0.0000165 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0729  amidohydrolase 2  26.35 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.455369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3555  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1748  amidohydrolase 2  27.84 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2429  amidohydrolase 2  29.12 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.067263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  34.5 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3739  amidohydrolase 2  32.39 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4405  amidohydrolase 2  25.39 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.290728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  28.74 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  28.85 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  32.26 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  31.94 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  31.18 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  31.77 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  32.02 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  27.01 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2859  amidohydrolase 2  26.46 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.88 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  31.18 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  27.23 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  28.88 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  33.99 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  33.99 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  33.99 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  30.62 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  31.52 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  27.65 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  25.93 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1765  amidohydrolase 2  28.51 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  26.82 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  28.94 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25.11 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  29.95 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  29.13 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  29.89 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  23.77 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  31.61 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  31.13 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0625  amidohydrolase 2  25.85 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  23.66 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  27.81 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  29.57 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.75 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3852  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  23.66 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 218 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  23.73 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1110  amidohydrolase 2  29.68 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  25.63 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  26.7 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  25.67 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  22.88 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  24.34 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1136  amidohydrolase 2  29.3 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2056  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153569  hitchhiker  0.000000238933 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  28.7 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  27.83 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  25.59 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4348  amidohydrolase 2  27.04 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.73 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1757  amidohydrolase 2  24.79 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.990764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>