More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0317 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  69.18 
 
 		 150 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 158 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.89 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 192 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 192 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  30.97 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  28.99 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 169 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 201 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 163 aa  60.1  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4161  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000235966  normal  0.7718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  27.83 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  29.2 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  29.71 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.37 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  30.23 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  24.76 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  28.37 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  28.37 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28.37 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  28.37 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  28.37 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  29.08 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>