113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2824 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2824  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  37.02 
 
 		 170 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  25.51 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  30.46 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  47.06 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  31.58 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  37.11 
 
 		 515 aa  55.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  28.28 
 
 		 511 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  35.29 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  35.11 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 418 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  34.12 
 
 		 128 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  39.19 
 
 		 136 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  28.57 
 
 		 140 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 95 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  27.57 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 87 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  35.94 
 
 		 82 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 847 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  40.98 
 
 		 85 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 466 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  37.31 
 
 		 65 aa  51.2  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 578 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1556  phage shock protein C, PspC  39.73 
 
 		 131 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  40.45 
 
 		 81 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  30.07 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 71 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2494  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 131 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  29.45 
 
 		 127 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2667  phage shock protein C, PspC  39.39 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  28.08 
 
 		 127 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  40.58 
 
 		 452 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  34.12 
 
 		 86 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  37.88 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 394 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 		 77 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  29.53 
 
 		 547 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  42.67 
 
 		 119 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  27.06 
 
 		 164 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  41.27 
 
 		 92 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  39.44 
 
 		 96 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  40.91 
 
 		 119 aa  48.9  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  45.71 
 
 		 129 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  29.31 
 
 		 169 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  34.85 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  35.38 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  39.19 
 
 		 582 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2622  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.71 
 
 		 119 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  normal  0.455397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  36.59 
 
 		 132 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  37.88 
 
 		 79 aa  47.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  31.93 
 
 		 306 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2608  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.91 
 
 		 121 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  47.27 
 
 		 81 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.58 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  38.24 
 
 		 96 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.58 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.58 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  32.81 
 
 		 86 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  40.79 
 
 		 128 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 68 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  33.75 
 
 		 119 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2333  DNA-binding transcriptional activator PspC  39.39 
 
 		 121 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  39.06 
 
 		 131 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  32 
 
 		 131 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 76 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  34.85 
 
 		 148 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  30.59 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 458 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  37.1 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  30.77 
 
 		 97 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 64 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  31.25 
 
 		 847 aa  44.7  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  45.9 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  45.9 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  28.83 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  45.9 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  45.9 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  30 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  45.9 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  45.9 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  45.9 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  45.9 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  39.34 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  45.9 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  31.75 
 
 		 61 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  28.9 
 
 		 445 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.06 
 
 		 533 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  40 
 
 		 70 aa  43.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  38.1 
 
 		 59 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  29.63 
 
 		 103 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>