More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1244 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  84.95 
 
 		 206 aa  367  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  78.23 
 
 		 125 aa  209  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1437  hypothetical protein  61.84 
 
 		 76 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000241003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  39.56 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  27.03 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.81 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  29.73 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  27.32 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  42.37 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  40.23 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2577  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  28.04 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  28.04 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  28.04 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  28.04 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  27.51 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  27.51 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>