87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1706 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 314 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1764  permease  43.18 
 
 		 316 aa  258  6e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  33 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  33 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  33 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  30.35 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1297  putative transporter YfdV  34.84 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2522  putative transporter YfdV  34.84 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2659  putative transporter YfdV  34.84 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2741  putative transporter YfdV  34.84 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3604  putative transporter YfdV  34.84 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.290153 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1285  Auxin Efflux Carrier  34.84 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1593  auxin efflux carrier  29.97 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  25.94 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  25.62 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  25 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  27.13 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.72 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0249  permease  28.48 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0415605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  24.84 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  25.99 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  25 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.39 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  24.07 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  25.7 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.65 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  25.66 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  23.6 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  25.52 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  25.56 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  24.27 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  25.91 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  29.19 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  30.49 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  23.29 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  23.6 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.8 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  23.05 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.29 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.61 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  28.03 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.8 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  23.29 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  23.95 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  27.46 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  23.71 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  28.99 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.88 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.52 
 
 		 306 aa  46.2  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  24.44 
 
 		 307 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  24.65 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  22.34 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  25.41 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  25 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  24.46 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  24.43 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  22.77 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  26.61 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  23.45 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  22.95 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  29.79 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  24.03 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  26.74 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  24.04 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  22.44 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 329 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>