126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3830 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  50.39 
 
 
1266 aa  1301    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  50.31 
 
 
1266 aa  1303    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  51.06 
 
 
1266 aa  1297    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  65.41 
 
 
1276 aa  1759    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  51.14 
 
 
1266 aa  1296    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  50.39 
 
 
1266 aa  1301    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  100 
 
 
1284 aa  2593    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  51.1 
 
 
1265 aa  1320    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  50.39 
 
 
1266 aa  1301    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  53.83 
 
 
1305 aa  1436    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  50.47 
 
 
1266 aa  1303    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  50.31 
 
 
1266 aa  1302    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  55.59 
 
 
1291 aa  1509    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  53.83 
 
 
1307 aa  1434    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  53.91 
 
 
1307 aa  1434    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  50.47 
 
 
1266 aa  1304    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  50.59 
 
 
1266 aa  1311    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  51.14 
 
 
1266 aa  1297    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  75.71 
 
 
1277 aa  2005    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  50.39 
 
 
1266 aa  1298    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  65.8 
 
 
1276 aa  1760    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  51.14 
 
 
1266 aa  1296    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  51.14 
 
 
1266 aa  1296    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  26.83 
 
 
1301 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  28.88 
 
 
1291 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  27.86 
 
 
1266 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  25.74 
 
 
1287 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  25.59 
 
 
1443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  23.87 
 
 
1323 aa  399  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  24.16 
 
 
1383 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  24.67 
 
 
1301 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  25.17 
 
 
1439 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  24.04 
 
 
1417 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  24.04 
 
 
1436 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  24.44 
 
 
1416 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  24.68 
 
 
1390 aa  352  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  24.52 
 
 
1419 aa  351  6e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  24 
 
 
1417 aa  348  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  23.68 
 
 
1441 aa  347  8e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  23.55 
 
 
1446 aa  346  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  23.48 
 
 
1392 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  23.6 
 
 
1454 aa  343  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  23.39 
 
 
1459 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  23.26 
 
 
1331 aa  332  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.77 
 
 
1307 aa  270  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  25.23 
 
 
1515 aa  259  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.91 
 
 
1271 aa  250  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.33 
 
 
1284 aa  247  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23.74 
 
 
1271 aa  246  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  23.36 
 
 
1267 aa  241  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  24.19 
 
 
1261 aa  233  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.24 
 
 
1273 aa  229  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  23.55 
 
 
1294 aa  229  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.31 
 
 
1265 aa  227  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.05 
 
 
1273 aa  224  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  23.9 
 
 
1277 aa  219  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  22.68 
 
 
1288 aa  217  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  23.24 
 
 
1419 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  23.64 
 
 
1275 aa  209  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.64 
 
 
1304 aa  207  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  23.64 
 
 
1276 aa  207  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  24.11 
 
 
1273 aa  206  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  24.89 
 
 
1309 aa  203  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  25.33 
 
 
1384 aa  202  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  23.34 
 
 
1381 aa  201  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  24.39 
 
 
1341 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  24.74 
 
 
1269 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  24.59 
 
 
1399 aa  195  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.05 
 
 
1346 aa  194  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  24.52 
 
 
1398 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.18 
 
 
1300 aa  189  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  24.95 
 
 
1399 aa  186  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  24.95 
 
 
1399 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  22.92 
 
 
1283 aa  184  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  24.44 
 
 
1426 aa  182  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  24.25 
 
 
1426 aa  180  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  23.74 
 
 
1426 aa  178  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  23.1 
 
 
1379 aa  177  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  23.8 
 
 
1419 aa  175  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  23.61 
 
 
1398 aa  174  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  24.15 
 
 
1306 aa  173  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  23.7 
 
 
1399 aa  171  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  26.24 
 
 
1398 aa  170  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  26.75 
 
 
1399 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  23.29 
 
 
1394 aa  169  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  22.01 
 
 
1283 aa  163  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  21.68 
 
 
1153 aa  162  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.92 
 
 
1286 aa  162  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  21.78 
 
 
1153 aa  161  6e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  23.25 
 
 
1397 aa  159  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  22.67 
 
 
1274 aa  159  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  22.96 
 
 
1397 aa  157  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  23.14 
 
 
1397 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  22.92 
 
 
1372 aa  156  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  22.97 
 
 
1368 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  22.87 
 
 
1290 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  22.92 
 
 
1397 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  22.92 
 
 
1397 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  23.07 
 
 
1397 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  23.67 
 
 
1141 aa  145  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>