More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2747 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 233 aa  487  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  74.89 
 
 		 262 aa  351  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  72.29 
 
 		 262 aa  348  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  64.91 
 
 		 236 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 255 aa  222  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  50.93 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 247 aa  215  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  50.23 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 312 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  44.35 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  45.37 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  46.58 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  46.48 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32.57 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  24.55 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.8 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  28.89 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.4 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  27.63 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  27.85 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 265 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  27.39 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  26.24 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  26.55 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0589  GntR domain protein  31.9 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  25.46 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  25.47 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>