125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0413 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1405 aa  2806    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  24.26 
 
 
1404 aa  215  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  27.19 
 
 
1500 aa  210  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  25.17 
 
 
1462 aa  207  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  28.52 
 
 
1448 aa  203  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  23.44 
 
 
1869 aa  190  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  23.94 
 
 
1530 aa  179  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  27.52 
 
 
1395 aa  177  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  24.96 
 
 
1448 aa  170  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  24.26 
 
 
1463 aa  169  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  24.5 
 
 
1428 aa  167  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  27.34 
 
 
1423 aa  166  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  24.96 
 
 
1550 aa  165  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  25.88 
 
 
1392 aa  165  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  24.31 
 
 
1463 aa  163  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  24.21 
 
 
1451 aa  160  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  28.95 
 
 
1276 aa  159  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  28.95 
 
 
1276 aa  159  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  22.58 
 
 
1489 aa  153  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  24.46 
 
 
2032 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  24.04 
 
 
2140 aa  146  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  27.35 
 
 
1396 aa  146  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  27.21 
 
 
1276 aa  145  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  23.87 
 
 
1441 aa  144  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  27.4 
 
 
1362 aa  142  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  22.45 
 
 
1550 aa  142  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  24.03 
 
 
1487 aa  142  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  25.97 
 
 
1270 aa  142  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  30.27 
 
 
1937 aa  142  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  26.76 
 
 
1398 aa  139  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  28.44 
 
 
1406 aa  139  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  25.95 
 
 
1084 aa  138  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  28.86 
 
 
1538 aa  136  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  26.68 
 
 
1319 aa  130  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  27.75 
 
 
1783 aa  128  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  27.05 
 
 
1206 aa  126  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  27.7 
 
 
1501 aa  124  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  24.18 
 
 
1256 aa  114  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  28.81 
 
 
1335 aa  110  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  24.66 
 
 
1515 aa  108  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  24.9 
 
 
1510 aa  108  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  24.78 
 
 
1578 aa  100  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  24.2 
 
 
1424 aa  90.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  23 
 
 
1377 aa  84.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.15 
 
 
1243 aa  83.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  24.84 
 
 
1184 aa  81.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  24.84 
 
 
1184 aa  81.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  25.68 
 
 
1361 aa  80.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  23.03 
 
 
1319 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  24.82 
 
 
1504 aa  78.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  22.36 
 
 
1325 aa  77.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  24.77 
 
 
1507 aa  78.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  24.95 
 
 
1507 aa  77.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  24.65 
 
 
1346 aa  73.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  23.6 
 
 
1453 aa  71.6  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  24.25 
 
 
1304 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  23.08 
 
 
1485 aa  68.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  24.14 
 
 
1505 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  23.1 
 
 
1297 aa  66.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  22.05 
 
 
1290 aa  65.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  23.4 
 
 
1299 aa  65.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  23.99 
 
 
1308 aa  65.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  23.04 
 
 
1352 aa  64.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0653  hypothetical protein  24.91 
 
 
1308 aa  63.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0907804  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  23.27 
 
 
1434 aa  63.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  22.78 
 
 
1317 aa  62.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  22.62 
 
 
1353 aa  62.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  27.72 
 
 
1310 aa  61.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  28.35 
 
 
1292 aa  61.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0688  protein of unknown function DUF490  24.23 
 
 
1308 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0687  protein of unknown function DUF490  24.23 
 
 
1308 aa  61.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343326  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  25.69 
 
 
1359 aa  60.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  23.02 
 
 
1221 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  22.53 
 
 
1285 aa  60.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.46 
 
 
1221 aa  59.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  23.26 
 
 
1304 aa  59.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  24.23 
 
 
1310 aa  58.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  22.99 
 
 
1305 aa  58.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  23.86 
 
 
1226 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  24.14 
 
 
1283 aa  57.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.07 
 
 
1473 aa  57.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  22.62 
 
 
1304 aa  57.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24.82 
 
 
1223 aa  57  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  21.69 
 
 
1485 aa  56.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  22.5 
 
 
1285 aa  55.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  24.3 
 
 
1206 aa  55.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  24.3 
 
 
1224 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  23.89 
 
 
1224 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  22.19 
 
 
1056 aa  54.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  20.53 
 
 
1328 aa  53.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  24.65 
 
 
1224 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  22.06 
 
 
1401 aa  53.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  21.31 
 
 
1254 aa  53.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.11 
 
 
1443 aa  53.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0253  protein of unknown function DUF490  34.48 
 
 
1503 aa  52.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  24.87 
 
 
1299 aa  52.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  23.56 
 
 
1290 aa  52.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  21.18 
 
 
1025 aa  52  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0240  hypothetical protein  21.31 
 
 
2049 aa  52  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.930824  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  24.86 
 
 
1449 aa  52  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0229632 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>