More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2789 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 675 aa  1389    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  33.38 
 
 		 652 aa  329  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 680 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 671 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 699 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  33.38 
 
 		 673 aa  300  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 681 aa  299  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 696 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 662 aa  273  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 645 aa  248  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 702 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 671 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 705 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 710 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  23.98 
 
 		 641 aa  111  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 640 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.89 
 
 		 656 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  22.87 
 
 		 668 aa  97.8  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 613 aa  97.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.57 
 
 		 639 aa  95.5  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 653 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  34.74 
 
 		 670 aa  93.6  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 634 aa  93.2  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 826 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  23.14 
 
 		 617 aa  90.1  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 635 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 688 aa  89.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 638 aa  88.6  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 714 aa  88.6  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  22.2 
 
 		 661 aa  87.8  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  21.73 
 
 		 686 aa  87.4  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.95 
 
 		 646 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  33.94 
 
 		 680 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.38 
 
 		 716 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  33.7 
 
 		 678 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 710 aa  85.1  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 679 aa  84.3  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  23.56 
 
 		 627 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 713 aa  84.3  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  22.98 
 
 		 665 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  22.98 
 
 		 665 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 698 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  26.2 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.21 
 
 		 653 aa  81.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 611 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.05 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.05 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  23.93 
 
 		 666 aa  80.9  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 687 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 648 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 624 aa  79.7  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 662 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  28.35 
 
 		 718 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  24.82 
 
 		 611 aa  79  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.78 
 
 		 653 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 659 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 712 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.36 
 
 		 695 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  34.47 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 707 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  24.73 
 
 		 668 aa  77.4  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  23.76 
 
 		 691 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  33.16 
 
 		 704 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 700 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 700 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  31.89 
 
 		 705 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 700 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.1 
 
 		 630 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.1 
 
 		 630 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  32.37 
 
 		 671 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  30.53 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 740 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  30.73 
 
 		 702 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  32.29 
 
 		 704 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  21.56 
 
 		 633 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.36 
 
 		 696 aa  75.1  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 715 aa  75.1  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 749 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  33.14 
 
 		 655 aa  75.1  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 700 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  27.59 
 
 		 618 aa  75.1  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 727 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 722 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.36 
 
 		 696 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  23.02 
 
 		 628 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 655 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 693 aa  74.3  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 643 aa  73.9  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.61 
 
 		 615 aa  73.9  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 658 aa  73.9  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.28 
 
 		 614 aa  73.9  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 656 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.21 
 
 		 615 aa  73.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 650 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 806 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.65 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>