More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2312 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2312  OmpA/MotB  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2645  OmpA/MotB  80.89 
 
 		 225 aa  350  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.69 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  31.4 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  30.95 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  39.81 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  39.22 
 
 		 310 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  41 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  39.22 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  39.22 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  39.22 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  39.22 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  39.22 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4235  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  39.22 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  38.24 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  40.22 
 
 		 560 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  40.22 
 
 		 560 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  36.89 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  40.22 
 
 		 560 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.22 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  33.6 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  26.67 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  35.58 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  32.67 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 376 aa  62  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.12 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 224 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  38.24 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  36.27 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  34.06 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  33.01 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  37.25 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 573 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  32.09 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  30.39 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  30.94 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.78 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  41 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  32.52 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.48 
 
 		 542 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  30.19 
 
 		 543 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 487 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  30.48 
 
 		 533 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  29.6 
 
 		 420 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  33.64 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  27.37 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 443 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  32.9 
 
 		 544 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  34.75 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.25 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.91 
 
 		 427 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  34.65 
 
 		 318 aa  58.2  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  34.62 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  42.25 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  37 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  34.95 
 
 		 415 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  37 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  36.89 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1913  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 363 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  36.27 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>