More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1378 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1378  porin  100 
 
 		 354 aa  706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  32.49 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  32.49 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  32.49 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  32.49 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  34.73 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  35.47 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  33.15 
 
 		 349 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.09 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  31.62 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  32.85 
 
 		 359 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  30.77 
 
 		 347 aa  119  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  30.48 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  30.71 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  31.44 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  29.67 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3809  porin  33.87 
 
 		 392 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  31.25 
 
 		 348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  31.34 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  29.84 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  31.34 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  30.75 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  32.59 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1963  porin  29.58 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.513284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  30.32 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.4 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  32.8 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  28.26 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  31.25 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.38 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  29.41 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  31.66 
 
 		 352 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  31.66 
 
 		 352 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  29.06 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  29.72 
 
 		 371 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  29.06 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  31.12 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.86 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0359  putative porin protein  29.58 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0373439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  28.69 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6530  outer membrane protein, (porin)-like  29.36 
 
 		 417 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  29.97 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  30.34 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  30.06 
 
 		 356 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  31.39 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.27 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  31.39 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  31.39 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  31.39 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  31.39 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.68 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  32.26 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  30.19 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  32.01 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  29.86 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  26.7 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  32.58 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  29.06 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2502  putative outer membrane protein (porin)  30.61 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506227  normal  0.418434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2108  putative outer membrane protein (porin)  30.61 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  28.28 
 
 		 349 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  32.11 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  32.2 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  31.69 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  29.77 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  28.13 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  31.09 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  30.16 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  30.59 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.39 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  29.32 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  30.72 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  29.08 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4315  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  30.56 
 
 		 357 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  31.32 
 
 		 355 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  30.58 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  27.61 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  29.67 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  30.5 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  30.39 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  30.39 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  30.39 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29 
 
 		 354 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  28.18 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  30.25 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  30.74 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  29.13 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2544  porin  32.82 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644529 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  31.23 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  29.18 
 
 		 372 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0904  porin  31.96 
 
 		 360 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.3308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  28.93 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  31.23 
 
 		 390 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  28.93 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  35.71 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  30.93 
 
 		 389 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  28.68 
 
 		 371 aa  95.9  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  29.7 
 
 		 352 aa  95.9  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  35.98 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  29.12 
 
 		 354 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>