139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1070 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  100 
 
 		 491 aa  1003    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.7 
 
 		 292 aa  151  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  36.06 
 
 		 628 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  37.95 
 
 		 327 aa  123  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  37.37 
 
 		 592 aa  117  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  35.53 
 
 		 266 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  34 
 
 		 320 aa  107  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  35.2 
 
 		 278 aa  99  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  35.57 
 
 		 574 aa  97.1  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  29.65 
 
 		 294 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  31.16 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  31.63 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  31.31 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  31.31 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  31.31 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  32.99 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30340  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  32.71 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0425  glycosy hydrolase family protein  31.61 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0487  glycosy hydrolase family protein  32.31 
 
 		 329 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.33357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  32.35 
 
 		 662 aa  78.6  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  30.61 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  30.61 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  31.65 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1185  glycoside hydrolase family 25  29.21 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  31.09 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  30.41 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1892  glycoside hydrolase family 25  31.09 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101469  hitchhiker  0.00660268 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0563  glycoside hydrolase family 25  29.28 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0159511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  30.29 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1039  glycoside hydrolase family 25  31.98 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0314219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  28.21 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1718  glycoside hydrolase family 25  27.04 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  28.51 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  31.98 
 
 		 251 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  34.02 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  27.69 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.69 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  28.5 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.69 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  28.72 
 
 		 277 aa  69.7  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  28.72 
 
 		 277 aa  69.7  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 		 333 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3081  glycosyl hydrolase family 25  28.65 
 
 		 272 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.150513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1439  glycoside hydrolase family 25  28.12 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1988  hypothetical protein  40.5 
 
 		 599 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  28.12 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6620  Lysozyme  32.31 
 
 		 291 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2112  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 261 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1369  hypothetical protein  33.55 
 
 		 349 aa  67  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  29.74 
 
 		 277 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  28.12 
 
 		 272 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  28.12 
 
 		 272 aa  67  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  27.18 
 
 		 267 aa  67  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  28.12 
 
 		 272 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  28.12 
 
 		 272 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  27.6 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0030  glycosy hydrolase family protein  26.39 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0210043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  27.09 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  27.09 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  27.09 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  27.6 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0797  glycoside hydrolase family 25  29.38 
 
 		 255 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.29 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2025  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2073  CHAP domain containing protein  31.91 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0286  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5548  hypothetical protein  35.34 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352514  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3072  CHAP domain containing protein  35.65 
 
 		 258 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.48 
 
 		 437 aa  54.7  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1754  CHAP domain-containing protein  30.43 
 
 		 228 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  25.65 
 
 		 268 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 829 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0460  prophage LambdaBa04, glycosyl hydrolase family protein 25  26.46 
 
 		 265 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.186644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0485  prophage lambdaba04, glycosyl hydrolase family protein 25  26.46 
 
 		 265 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.95 
 
 		 331 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  29.44 
 
 		 241 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2530  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 292 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 		 744 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0703  glycoside hydrolase family 25  24.38 
 
 		 257 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  0.422369 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0604  endolysin  28.95 
 
 		 266 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2740  glycoside hydrolase family 25  23.56 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  23.26 
 
 		 935 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  26.84 
 
 		 380 aa  50.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  30.37 
 
 		 262 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  30.69 
 
 		 216 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3072  CHAP domain containing protein  31.93 
 
 		 201 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2649  CHAP domain containing protein  32.45 
 
 		 279 aa  49.3  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.112963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  33.05 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  27.15 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  45 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  39.47 
 
 		 297 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>