179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2371 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  80 
 
 		 227 aa  345  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  61.4 
 
 		 223 aa  234  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0877  transcriptional regulator, TetR family  60.58 
 
 		 222 aa  228  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5834  transcriptional regulator, TetR family  61.32 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4137  TetR family transcriptional regulator  60.75 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.857074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  30.2 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  31.33 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  31.85 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  29.35 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 299 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1213  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.02381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  39.73 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  30.81 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 176 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  26.62 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>