242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5834 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5834  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  62.84 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  61.32 
 
 		 219 aa  244  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  59.82 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0877  transcriptional regulator, TetR family  60.09 
 
 		 222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4137  TetR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.857074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  36.65 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  29.47 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 266 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  31.72 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  27.36 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  32.8 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  28.87 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 182 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 196 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 299 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  26.62 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  25.82 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  31.08 
 
 		 174 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  46.77 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 186 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 288 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  24.09 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>