148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5333 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  22.9 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  25.55 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  31.11 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  31.11 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  42.86 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1265  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000976075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  33.87 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 325 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  34.83 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 		 325 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  24.3 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 326 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 326 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 326 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  39.29 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0194  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  35.71 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  31.15 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  34.85 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  35.71 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  35.71 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  35.71 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  35.71 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  35.71 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  35.71 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  26.44 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  35.71 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  23.94 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 326 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1151  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 138 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  27.97 
 
 		 156 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  32.14 
 
 		 153 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 152 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  28 
 
 		 154 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  22.22 
 
 		 151 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  28.71 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>