More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4511 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  100 
 
 		 555 aa  1146    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  38.72 
 
 		 365 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  37.62 
 
 		 675 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  32.29 
 
 		 395 aa  180  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  32.53 
 
 		 391 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  31.94 
 
 		 357 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3510  beta-lactamase  31.8 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.189437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  31.02 
 
 		 502 aa  143  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.02 
 
 		 487 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.34 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1599  beta-lactamase  31.2 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0074  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1037 aa  116  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.369205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  27.3 
 
 		 580 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.66 
 
 		 595 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.93 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  27.24 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.93 
 
 		 513 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  24.17 
 
 		 496 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  22.74 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  29.25 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  26.63 
 
 		 513 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  28.97 
 
 		 410 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  26.76 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  28.13 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  28.85 
 
 		 410 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  25.23 
 
 		 377 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  27.4 
 
 		 477 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  27.22 
 
 		 456 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  26.4 
 
 		 460 aa  97.4  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.03 
 
 		 601 aa  97.1  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  33.14 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.38 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  24.74 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  26.24 
 
 		 616 aa  94.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  30.5 
 
 		 796 aa  94.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  26.18 
 
 		 345 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  25.88 
 
 		 345 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  30.5 
 
 		 796 aa  94.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  25.88 
 
 		 374 aa  94  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  26.18 
 
 		 374 aa  94  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  29.11 
 
 		 517 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  24.03 
 
 		 578 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  25.62 
 
 		 429 aa  93.6  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.1 
 
 		 446 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  26.77 
 
 		 567 aa  93.2  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  28.41 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  33.33 
 
 		 423 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  25.88 
 
 		 345 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.98 
 
 		 681 aa  90.9  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  26.32 
 
 		 507 aa  90.9  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.89 
 
 		 356 aa  90.5  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  26.18 
 
 		 345 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  25.44 
 
 		 345 aa  90.1  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.89 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29.26 
 
 		 966 aa  89.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  23.7 
 
 		 497 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  37.3 
 
 		 484 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  29.08 
 
 		 395 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  28.57 
 
 		 395 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  26.92 
 
 		 848 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  31.69 
 
 		 501 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.13 
 
 		 588 aa  87  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  23.73 
 
 		 494 aa  87  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  26.52 
 
 		 476 aa  87  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  25.91 
 
 		 497 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  28.57 
 
 		 285 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  29.34 
 
 		 793 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  26.81 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  25.31 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  24.72 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  34.25 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  22.87 
 
 		 637 aa  84.7  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.41 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.17 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.29 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  26.49 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  23.92 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  25.16 
 
 		 614 aa  83.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  28.83 
 
 		 395 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  28.57 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.98 
 
 		 388 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  34.24 
 
 		 790 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  29.34 
 
 		 390 aa  83.2  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  26.89 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  29.43 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  29.61 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  23.64 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  22.85 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2553  beta-lactamase  24.78 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  23.64 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  26.42 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  25.68 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.16 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.69 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  34.1 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  30.62 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.29 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2466  hypothetical protein  26.52 
 
 		 504 aa  81.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  27.93 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.1 
 
 		 834 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>