More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2961 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 593 aa  1197    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  51.06 
 
 		 550 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  42.88 
 
 		 524 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  42.06 
 
 		 545 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  42.94 
 
 		 600 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  38.87 
 
 		 570 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  39 
 
 		 563 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  38.79 
 
 		 563 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  36.99 
 
 		 563 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  36.99 
 
 		 563 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  38.45 
 
 		 579 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  37 
 
 		 566 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  43.8 
 
 		 520 aa  320  6e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 		 572 aa  316  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  32.91 
 
 		 559 aa  286  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 571 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  35.37 
 
 		 556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 545 aa  266  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 545 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  43.23 
 
 		 481 aa  254  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 546 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 538 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 542 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 545 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 545 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 		 557 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 545 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  43.06 
 
 		 230 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  29.64 
 
 		 581 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  25.64 
 
 		 273 aa  99  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 		 358 aa  98.6  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 395 aa  95.9  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 322 aa  94.7  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 		 345 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  24.51 
 
 		 270 aa  87  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  24.3 
 
 		 289 aa  86.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 636 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 636 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 		 267 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  27.59 
 
 		 270 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 307 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 267 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.03 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  25.93 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  26.39 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  25.47 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  25 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 362 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  25.85 
 
 		 258 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  25.68 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  27.96 
 
 		 1117 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  25.36 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  26.13 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  26.51 
 
 		 1144 aa  74.3  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  26.7 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.71 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  23.95 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  24.54 
 
 		 287 aa  73.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  25.7 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 874 aa  72  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  28.89 
 
 		 732 aa  71.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  25.76 
 
 		 1118 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  25.76 
 
 		 1118 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  25.76 
 
 		 1120 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  25.76 
 
 		 1118 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  25.76 
 
 		 1120 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  30.11 
 
 		 753 aa  70.1  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  23.35 
 
 		 270 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  24.31 
 
 		 1120 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.9 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1120 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  24.88 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  24.31 
 
 		 1120 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  24.71 
 
 		 1115 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  24.31 
 
 		 1118 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>