68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1429 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  100 
 
 		 279 aa  551  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  52.3 
 
 		 279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  46.49 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  40.45 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  44.44 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  33.69 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  54.95 
 
 		 413 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  36.96 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  32.64 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  35 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  30.93 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  45.79 
 
 		 804 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  42.68 
 
 		 156 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  46.67 
 
 		 150 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  40.77 
 
 		 156 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  44.86 
 
 		 506 aa  99  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  45.79 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  44.34 
 
 		 472 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  45.1 
 
 		 668 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  36.75 
 
 		 604 aa  89  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  40.21 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  35.71 
 
 		 143 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  45.63 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  41.75 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  40 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  44.23 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  42.86 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  39.56 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  42.39 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  32.65 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  35.45 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  37.89 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  30.7 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  29.41 
 
 		 583 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  33.33 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  28.32 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  36.36 
 
 		 122 aa  52.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  32.99 
 
 		 447 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2309  hypothetical protein  55 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  33.33 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  32.48 
 
 		 467 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  32.68 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  34.21 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  31.18 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4087  hypothetical protein  43.75 
 
 		 100 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.1 
 
 		 112 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  29.47 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4165  TonB family protein  30 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000230804  hitchhiker  0.00000000895205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  29.51 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  32.89 
 
 		 235 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  29.11 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  30.93 
 
 		 446 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  34.25 
 
 		 236 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.11 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  39.47 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  33.72 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  26.25 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  30.77 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  32.1 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  30.99 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  26.97 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  36.84 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  36.84 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  36.84 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  29.82 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  29.03 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  36.84 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>