More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1411 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1411  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884268 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0970  HpcH/HpaI aldolase  97.1 
 
 		 310 aa  615  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0326434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1044  HpcH/HpaI aldolase  96.45 
 
 		 315 aa  614  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2198  HpcH/HpaI aldolase  95.48 
 
 		 315 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1111  HpcH/HpaI aldolase  49.44 
 
 		 310 aa  282  6.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.761795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1180  HpcH/HpaI aldolase  41.73 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451315  hitchhiker  0.00501753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.68 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  33.58 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  33.59 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  33.2 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  33.2 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  34.1 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  27.63 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  28.47 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  28.52 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  31.68 
 
 		 295 aa  95.9  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  29.55 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  32.95 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  30.77 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  32.25 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  28.67 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  31.17 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  27.21 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  30.39 
 
 		 283 aa  92.4  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  30.98 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  28.63 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  27.21 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  30.27 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  27.78 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  29.47 
 
 		 287 aa  89  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  29.12 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  27.55 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  31.01 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  31.23 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  29.93 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  31.87 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  30.99 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  30.77 
 
 		 278 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  29.66 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  31.54 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  29.93 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  29.26 
 
 		 271 aa  86.3  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  27.11 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  31.03 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  31.54 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  31.47 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  29.73 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  30.5 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  29.57 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  28 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  31.73 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  28.32 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  31.42 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  30.39 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  27.69 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  29.23 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  32.79 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  25 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  30.77 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  29.47 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  28.14 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  32.81 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  30.77 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  31.09 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0901  Citrate (pro-3S)-lyase  29.62 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4207  Citryl-CoA lyase  28.15 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486411  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  29.58 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  26.76 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  28.88 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  26.76 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  26.76 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  26.76 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  26.76 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  28.17 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  31.34 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  27.47 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  27.62 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  27.82 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  28.88 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  28.67 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  29.48 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  27.46 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  27.27 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  29.57 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  26.3 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  26.95 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  28.52 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  27.82 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  26.69 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0092  HpcH/HpaI aldolase  27.7 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  26.45 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  31.1 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.32 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  27.92 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  27.55 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.32 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.32 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.32 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  26.77 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>