More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0393 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0393  putative type II protein secretion system F protein CtsF  100 
 
 		 321 aa  638    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  40.36 
 
 		 392 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  38.69 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  38.69 
 
 		 392 aa  205  9e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1232  transcription regulator AsnC  32.11 
 
 		 411 aa  169  7e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1051  type II secretion system protein  29.97 
 
 		 413 aa  165  8e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1963  type II secretion system protein  30.09 
 
 		 415 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1011  type II secretion system protein  30.18 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  27.9 
 
 		 407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  27.22 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  26.71 
 
 		 407 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  27.86 
 
 		 407 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  26.79 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  25.54 
 
 		 405 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1388  type II secretion system protein  29.54 
 
 		 414 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  25.55 
 
 		 404 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  26.48 
 
 		 406 aa  136  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  24.61 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  24.92 
 
 		 405 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  26.63 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  26.17 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  25.23 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  24.3 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  24.92 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  24.61 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  24.92 
 
 		 406 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  24.61 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  24.32 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  22.98 
 
 		 409 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  22.91 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  25.47 
 
 		 408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 412 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  24.23 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  26.81 
 
 		 405 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  23.01 
 
 		 408 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 405 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  26.59 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  23.9 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  23.15 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  25.52 
 
 		 408 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  26.39 
 
 		 405 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  23.62 
 
 		 408 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  24 
 
 		 420 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  25.38 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  24 
 
 		 424 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  22.57 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  23.15 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  24.77 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  24.01 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  22.05 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  22.22 
 
 		 407 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  23.22 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  21.02 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  22.94 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  23.85 
 
 		 401 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  23.1 
 
 		 404 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  23.1 
 
 		 404 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0932  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 408 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  0.0185308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  25.51 
 
 		 417 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  23.05 
 
 		 405 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  22.09 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  22.53 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  22.46 
 
 		 403 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  23.01 
 
 		 408 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  23.4 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58760  type 4 fimbrial biogenesis protein pilC  24.54 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.95906  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  23.31 
 
 		 406 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  23.42 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  23.93 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.47 
 
 		 402 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  20.68 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  23.18 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  24.32 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  21.65 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  19.82 
 
 		 463 aa  99.8  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  19.58 
 
 		 463 aa  99  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  22.46 
 
 		 405 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  23.01 
 
 		 424 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  21.03 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  22.48 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  26.89 
 
 		 406 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  22.32 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  22.16 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  22.3 
 
 		 401 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.47 
 
 		 419 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  21.47 
 
 		 401 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  22.29 
 
 		 422 aa  96.3  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  21.69 
 
 		 406 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  23.4 
 
 		 406 aa  95.9  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  19.82 
 
 		 417 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  25.38 
 
 		 405 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  25.38 
 
 		 405 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  24.79 
 
 		 405 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>