More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2990 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2990  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
428 aa  858    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1286  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.3 
 
 
509 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  40.29 
 
 
453 aa  275  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  41.59 
 
 
409 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  40.14 
 
 
385 aa  239  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  35.07 
 
 
389 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.66 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1890  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.84 
 
 
521 aa  234  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.206887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  39.08 
 
 
393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  39.07 
 
 
518 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  35.77 
 
 
442 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  39.56 
 
 
459 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  35.85 
 
 
535 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  45.26 
 
 
453 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  41.69 
 
 
453 aa  201  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  37.1 
 
 
395 aa  200  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  35.4 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.1 
 
 
401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3533  HtrA2 peptidase  39.64 
 
 
406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.94 
 
 
386 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  38.91 
 
 
501 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.61 
 
 
513 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  44.06 
 
 
481 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  38.35 
 
 
404 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  33.65 
 
 
412 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.42 
 
 
476 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  43 
 
 
482 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  39.02 
 
 
361 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  39.72 
 
 
477 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  38.32 
 
 
369 aa  194  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  35.48 
 
 
502 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  37.74 
 
 
473 aa  193  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  35.48 
 
 
502 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  35.48 
 
 
502 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  35.65 
 
 
413 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  37.78 
 
 
450 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  43.11 
 
 
473 aa  193  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  41.78 
 
 
502 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  41.78 
 
 
502 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  43.01 
 
 
499 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  41.78 
 
 
485 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.39 
 
 
464 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  43.01 
 
 
499 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  41.78 
 
 
461 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  38.69 
 
 
398 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  35.2 
 
 
502 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  39.17 
 
 
396 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  37.2 
 
 
511 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  42.65 
 
 
490 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.64 
 
 
474 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  43.31 
 
 
474 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  43.16 
 
 
462 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  43.01 
 
 
500 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  42.42 
 
 
419 aa  191  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1783  2-alkenal reductase  37.54 
 
 
424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1818  2-alkenal reductase  37.54 
 
 
424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  37.5 
 
 
450 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  37.5 
 
 
450 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  39.02 
 
 
387 aa  190  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  42.65 
 
 
485 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  44.17 
 
 
501 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  37.25 
 
 
511 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  39.79 
 
 
459 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  41.44 
 
 
507 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  39.51 
 
 
474 aa  189  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  39.79 
 
 
459 aa  189  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  41.58 
 
 
505 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  37.5 
 
 
450 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  39.04 
 
 
485 aa  189  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  42.65 
 
 
498 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  39.55 
 
 
508 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  42.65 
 
 
498 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  42.65 
 
 
498 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  37.5 
 
 
411 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.61 
 
 
478 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  40.13 
 
 
467 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.93 
 
 
474 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.28 
 
 
398 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  40.24 
 
 
412 aa  188  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  38.86 
 
 
404 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  40.62 
 
 
487 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  34.39 
 
 
464 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.09 
 
 
428 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.06 
 
 
349 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  37.03 
 
 
577 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.73 
 
 
387 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.81 
 
 
457 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  38.82 
 
 
388 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  43.73 
 
 
498 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.65 
 
 
412 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.19 
 
 
415 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  38.86 
 
 
404 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  39.65 
 
 
514 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.23 
 
 
405 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  37.61 
 
 
449 aa  187  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  35.45 
 
 
415 aa  186  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  38.73 
 
 
484 aa  186  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  40.96 
 
 
403 aa  186  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  38.02 
 
 
449 aa  186  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  36.94 
 
 
451 aa  186  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>