More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5385 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5385  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.983573 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5436  ATP-dependent transcription regulator LuxR  69.39 
 
 		 891 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0429  regulatory protein, LuxR  34.75 
 
 		 884 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0441  regulatory protein, LuxR  32.84 
 
 		 856 aa  74.3  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.46 
 
 		 889 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 		 907 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 907 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0611  regulatory protein, LuxR  29.63 
 
 		 878 aa  64.7  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000972895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  44.26 
 
 		 907 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  44.26 
 
 		 921 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.04 
 
 		 955 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.04 
 
 		 897 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.14 
 
 		 901 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.4 
 
 		 914 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  35.34 
 
 		 906 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3567  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.26 
 
 		 251 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2039  LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 917 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 917 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 917 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2330  LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 917 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3097  LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 898 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0989415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 906 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  42.67 
 
 		 947 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  44.16 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  44.29 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  52.73 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1436  GerE family regulatory protein  30.15 
 
 		 921 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.26 
 
 		 932 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.62 
 
 		 900 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 924 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 901 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  29.66 
 
 		 916 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.26 
 
 		 867 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.85 
 
 		 870 aa  58.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  50.91 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.19 
 
 		 900 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.95 
 
 		 922 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  31.01 
 
 		 887 aa  57.8  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3317  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  46.3 
 
 		 894 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.31 
 
 		 921 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.31 
 
 		 921 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38930  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.31 
 
 		 921 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4179  hypothetical protein  47.46 
 
 		 232 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  36.46 
 
 		 913 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  51.92 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2665  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3138  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2173  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.06 
 
 		 928 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0094  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  37.97 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  45.45 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  32.17 
 
 		 891 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.72 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.94 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  51.92 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  40.3 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2672  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.240505 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1422  DNA-binding response regulator VraR  37.33 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.871667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  40 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.62 
 
 		 930 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.7 
 
 		 1019 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.62 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  46.77 
 
 		 914 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  40.98 
 
 		 896 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.04 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>