More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0611 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0441  regulatory protein, LuxR  78.42 
 
 
856 aa  1385    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0611  regulatory protein, LuxR  100 
 
 
878 aa  1809    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000972895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0429  regulatory protein, LuxR  32.57 
 
 
884 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5436  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.39 
 
 
891 aa  301  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170631  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5389  regulatory protein, LuxR  32.23 
 
 
267 aa  114  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.621968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.27 
 
 
930 aa  94  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  21.77 
 
 
905 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  22.14 
 
 
901 aa  84.7  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  21.87 
 
 
896 aa  81.6  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  22.63 
 
 
907 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.11 
 
 
924 aa  80.5  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.26 
 
 
914 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  22.48 
 
 
907 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.31 
 
 
922 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.35 
 
 
955 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.18 
 
 
897 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.08 
 
 
928 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.19 
 
 
913 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  20.24 
 
 
896 aa  65.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5385  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.63 
 
 
182 aa  64.7  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.983573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.48 
 
 
900 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  20.75 
 
 
947 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.52 
 
 
894 aa  63.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  42.03 
 
 
921 aa  63.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3564  MalT  25.57 
 
 
695 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534347  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  37.63 
 
 
993 aa  62  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.23 
 
 
914 aa  61.6  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.46 
 
 
921 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.46 
 
 
921 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.46 
 
 
921 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.82 
 
 
889 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 
910 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
191 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  40 
 
 
223 aa  58.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  43.28 
 
 
901 aa  58.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 
213 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5261  competence protein A  35 
 
 
213 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  23.12 
 
 
855 aa  57.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.91 
 
 
867 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  42.03 
 
 
913 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
231 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1766  two component LuxR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
203 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00488071  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.34 
 
 
1019 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  23.45 
 
 
758 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  40.54 
 
 
220 aa  56.6  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
234 aa  56.6  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5778  cyclic nucleotide-binding protein  41.11 
 
 
353 aa  57  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.714206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 
258 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  40 
 
 
222 aa  55.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5308  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.33 
 
 
397 aa  56.2  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.418046  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.56 
 
 
905 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0670  regulatory protein, LuxR  24.04 
 
 
890 aa  55.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  38.46 
 
 
214 aa  55.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  21.12 
 
 
944 aa  55.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
209 aa  55.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.55 
 
 
932 aa  55.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
214 aa  55.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  36.47 
 
 
205 aa  55.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
204 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  36.62 
 
 
210 aa  55.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  45 
 
 
214 aa  55.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 
206 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  42.62 
 
 
911 aa  55.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 
214 aa  55.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  36.62 
 
 
210 aa  55.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
223 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  36.62 
 
 
210 aa  55.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  31.9 
 
 
920 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
212 aa  55.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  43.55 
 
 
217 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  40.32 
 
 
214 aa  55.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
141 aa  55.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.04 
 
 
947 aa  54.7  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
222 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  35.29 
 
 
862 aa  54.7  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 
982 aa  54.7  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  36.51 
 
 
964 aa  54.7  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  39.34 
 
 
907 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 
188 aa  54.3  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  35.29 
 
 
894 aa  54.3  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.67 
 
 
309 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
220 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
209 aa  54.3  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
146 aa  53.9  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 
207 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
244 aa  54.3  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.76 
 
 
905 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
209 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 
234 aa  54.3  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 
861 aa  53.9  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  35.06 
 
 
900 aa  54.3  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  40.98 
 
 
913 aa  54.3  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  44.64 
 
 
933 aa  54.3  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1436  GerE family regulatory protein  41.94 
 
 
921 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.96 
 
 
876 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 
209 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
231 aa  53.5  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
208 aa  53.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
917 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
917 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>