More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0441 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0441  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 856 aa  1774    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0611  regulatory protein, LuxR  78.42 
 
 		 878 aa  1385    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000972895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0429  regulatory protein, LuxR  32.43 
 
 		 884 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5436  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.94 
 
 		 891 aa  312  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5389  regulatory protein, LuxR  30.71 
 
 		 267 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.621968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.65 
 
 		 921 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.65 
 
 		 921 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.66 
 
 		 955 aa  92.8  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.53 
 
 		 921 aa  92.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.55 
 
 		 897 aa  90.9  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  20.81 
 
 		 922 aa  90.5  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.4 
 
 		 914 aa  87.8  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.62 
 
 		 924 aa  85.9  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  22.71 
 
 		 901 aa  85.1  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  23.39 
 
 		 896 aa  83.2  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  21.71 
 
 		 921 aa  76.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  23.15 
 
 		 907 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.15 
 
 		 928 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  21.9 
 
 		 907 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5385  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.84 
 
 		 182 aa  74.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.983573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  21.75 
 
 		 920 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.37 
 
 		 930 aa  68.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.38 
 
 		 889 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 904 aa  63.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  47.62 
 
 		 933 aa  62.4  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 214 aa  62.4  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.44 
 
 		 900 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.79 
 
 		 901 aa  61.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.16 
 
 		 1021 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5308  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.33 
 
 		 397 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.418046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  22.11 
 
 		 905 aa  60.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 244 aa  59.7  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.73 
 
 		 867 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  34.94 
 
 		 913 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 217 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.11 
 
 		 894 aa  58.9  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 862 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 910 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 		 234 aa  57.4  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  35.8 
 
 		 914 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 225 aa  57.4  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 537 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5878  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 441 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.464013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 231 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 223 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 191 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 209 aa  56.6  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  32.88 
 
 		 907 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1766  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 203 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00488071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  35.8 
 
 		 967 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 257 aa  56.2  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  38.24 
 
 		 911 aa  55.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.33 
 
 		 905 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  34.92 
 
 		 894 aa  56.2  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.66 
 
 		 1019 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 207 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 258 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 905 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 214 aa  55.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  38.81 
 
 		 214 aa  55.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 216 aa  55.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 220 aa  55.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  38.16 
 
 		 905 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 219 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 214 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 219 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 213 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3567  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.7 
 
 		 251 aa  55.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 526 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 224 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  44.23 
 
 		 214 aa  55.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 906 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 210 aa  55.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1011  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 203 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 		 526 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2176  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.21 
 
 		 888 aa  55.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  44.23 
 
 		 214 aa  55.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 		 526 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 226 aa  54.7  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  21.55 
 
 		 1108 aa  55.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  35.94 
 
 		 964 aa  54.7  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1303  transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 442 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 226 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  34.21 
 
 		 900 aa  54.7  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 226 aa  54.7  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3564  MalT  22.53 
 
 		 695 aa  54.7  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 222 aa  54.7  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 982 aa  54.7  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 225 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7606  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 214 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2902  LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 153 aa  54.3  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 544 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.62 
 
 		 309 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2245  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 218 aa  54.3  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00227369  normal  0.0543921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 544 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>