More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1074 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 481 aa  967    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 713 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 586 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 713 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  40 
 
 		 717 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 850 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 759 aa  182  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 725 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 840 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 601 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 		 642 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 662 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 		 409 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  35.7 
 
 		 872 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 512 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 738 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 907 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 489 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 		 384 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 304 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 588 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 		 571 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.99 
 
 		 1167 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 602 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  41.71 
 
 		 261 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 728 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  38.25 
 
 		 1160 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 258 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  30.02 
 
 		 728 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  30.39 
 
 		 733 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 1016 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 387 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  36.41 
 
 		 1041 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  29.14 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 559 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 500 aa  154  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  33.69 
 
 		 463 aa  154  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 934 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 929 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 1191 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 930 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 489 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.93 
 
 		 1190 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  41.33 
 
 		 561 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 897 aa  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 275 aa  150  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 341 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 583 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  32.61 
 
 		 583 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 1001 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 488 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  37.89 
 
 		 930 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 582 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 583 aa  147  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  36.33 
 
 		 334 aa  146  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  36.59 
 
 		 488 aa  146  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.5 
 
 		 820 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  40 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  30.31 
 
 		 460 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  42.29 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 338 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.5 
 
 		 1079 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 		 1092 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 1002 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 489 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 631 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 336 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 677 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  35.1 
 
 		 326 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4702  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  50.75 
 
 		 464 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.781083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.51 
 
 		 624 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 344 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 901 aa  136  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 1557 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2409  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.49 
 
 		 729 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.798311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  36.33 
 
 		 842 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 553 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 336 aa  134  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 358 aa  133  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  41.86 
 
 		 538 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 336 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 639 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>