More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0857 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  67.42 
 
 
185 aa  251  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  63.48 
 
 
185 aa  242  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  51.1 
 
 
203 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  46.74 
 
 
211 aa  174  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.73 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  40.12 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  38.95 
 
 
171 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  42.93 
 
 
180 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  41.92 
 
 
188 aa  121  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  45.33 
 
 
157 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  42.48 
 
 
192 aa  120  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  40.52 
 
 
175 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.86 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.86 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  42.04 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  38.56 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  38.56 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  45.33 
 
 
157 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  42.48 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  38.5 
 
 
187 aa  117  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  37.95 
 
 
188 aa  117  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  41.18 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  39.47 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  44.08 
 
 
158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  34.92 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  38.5 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1690  peptide deformylase  43.14 
 
 
172 aa  115  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.736434  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  40.26 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  35.68 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  43.42 
 
 
156 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  38.82 
 
 
187 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  43.42 
 
 
156 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  37.65 
 
 
201 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  42.2 
 
 
171 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  37.65 
 
 
201 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2034  peptide deformylase  40.59 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  41.18 
 
 
173 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.51 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  39.55 
 
 
172 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  37.58 
 
 
201 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  42.76 
 
 
156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  42.76 
 
 
156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  42.76 
 
 
156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  42.76 
 
 
156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  37.8 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  37.66 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  37.66 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  38.69 
 
 
169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  40.61 
 
 
154 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  37.58 
 
 
203 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  42.48 
 
 
156 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  38.92 
 
 
177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  42.38 
 
 
156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  37.57 
 
 
193 aa  111  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  39.87 
 
 
176 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  37.89 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  40.11 
 
 
168 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  37.28 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  36.2 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  39.07 
 
 
187 aa  111  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  41.67 
 
 
153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  37.36 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  39.36 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  37.36 
 
 
173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  36.61 
 
 
164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.36 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  38.46 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1783  peptide deformylase  44.14 
 
 
172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  38.95 
 
 
187 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  39.15 
 
 
169 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.2 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  38.37 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  37.57 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  40.24 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  38.32 
 
 
179 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  40.11 
 
 
167 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  39.01 
 
 
168 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  38.46 
 
 
175 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  43.05 
 
 
189 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  40.21 
 
 
169 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  39.05 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  38.16 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2532  peptide deformylase  38.92 
 
 
196 aa  107  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  35.56 
 
 
167 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  37.02 
 
 
179 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  36.47 
 
 
180 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  40.85 
 
 
147 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  40.38 
 
 
170 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  38.31 
 
 
188 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  39.1 
 
 
169 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  39.88 
 
 
178 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  40.94 
 
 
175 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  36.55 
 
 
202 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  38.46 
 
 
168 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  40 
 
 
156 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  40.94 
 
 
175 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  33.53 
 
 
202 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  40.94 
 
 
175 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  37.13 
 
 
185 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>