70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0142 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  100 
 
 		 496 aa  981    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  44.56 
 
 		 504 aa  323  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  42.72 
 
 		 503 aa  322  8e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  35.27 
 
 		 474 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  25.51 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  25 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.45 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  22.49 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  23.91 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  29.39 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  25.35 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  24.91 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  27.8 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  25.98 
 
 		 540 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  27.96 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  25.85 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  28.81 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  28.81 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  25.26 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.76 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  26.96 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  22.81 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  27.6 
 
 		 464 aa  57  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  26.98 
 
 		 607 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  27.1 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.2 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  27.36 
 
 		 415 aa  54.7  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  27.93 
 
 		 668 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  26.51 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  29.29 
 
 		 773 aa  53.5  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  23.97 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  28.7 
 
 		 672 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  26.36 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  25.31 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  23.73 
 
 		 500 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  25.54 
 
 		 437 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  23.51 
 
 		 461 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  37.36 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  31.36 
 
 		 671 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  30.36 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  26.32 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  25.53 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  25.24 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  22.92 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  23.53 
 
 		 497 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  27.5 
 
 		 402 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2653  O-antigen polymerase  26.09 
 
 		 499 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  29.24 
 
 		 595 aa  47  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  25.41 
 
 		 425 aa  47  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  21.43 
 
 		 585 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  31 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  27.93 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  26.81 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  31.58 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  25.56 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  29.13 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 452 aa  45.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  27.83 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  26.71 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  26.23 
 
 		 579 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  26.42 
 
 		 594 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  22.38 
 
 		 545 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  26.87 
 
 		 439 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  37.5 
 
 		 453 aa  43.9  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  22.74 
 
 		 461 aa  43.9  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  22.39 
 
 		 470 aa  43.5  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  26.95 
 
 		 468 aa  43.5  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  24.71 
 
 		 495 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>