More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1954 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  74.96 
 
 
578 aa  906    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  77.2 
 
 
578 aa  967    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  100 
 
 
579 aa  1199    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  78.68 
 
 
577 aa  974    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  76.51 
 
 
578 aa  924    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  77.37 
 
 
578 aa  968    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2158  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  50.77 
 
 
585 aa  597  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.625717  normal  0.662886 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.23 
 
 
579 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1661  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.08 
 
 
648 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.92 
 
 
647 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2193  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.03 
 
 
648 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.119268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2477  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  39.27 
 
 
653 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.3 
 
 
541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2152  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.8 
 
 
571 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000764519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.38 
 
 
544 aa  320  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0703  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.64 
 
 
543 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.26 
 
 
552 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.45 
 
 
546 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  33.33 
 
 
542 aa  302  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4108  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.21 
 
 
543 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112813  normal  0.10156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.92 
 
 
996 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4866  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.98 
 
 
559 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4955  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.98 
 
 
559 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5234  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.98 
 
 
558 aa  280  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542472  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  33.16 
 
 
688 aa  267  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.17 
 
 
1487 aa  265  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.58 
 
 
1481 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  32.2 
 
 
1150 aa  258  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.39 
 
 
699 aa  250  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  33.21 
 
 
1073 aa  248  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
1126 aa  247  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.34 
 
 
1426 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.81 
 
 
1410 aa  242  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.84 
 
 
658 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.58 
 
 
1406 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.66 
 
 
654 aa  236  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.01 
 
 
891 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  31.11 
 
 
1412 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.83 
 
 
1424 aa  230  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.94 
 
 
1421 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  30.71 
 
 
1387 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  29.82 
 
 
1385 aa  229  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  29.69 
 
 
653 aa  228  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.66 
 
 
1480 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.95 
 
 
895 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.12 
 
 
1425 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.26 
 
 
555 aa  226  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.82 
 
 
1425 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  31.06 
 
 
771 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.54 
 
 
653 aa  225  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.44 
 
 
1440 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.94 
 
 
1425 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.4 
 
 
483 aa  223  7e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.95 
 
 
914 aa  222  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  31.17 
 
 
653 aa  221  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.55 
 
 
612 aa  218  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  31.34 
 
 
771 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.59 
 
 
1440 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  34.65 
 
 
464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.16 
 
 
1432 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.16 
 
 
1432 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.16 
 
 
1432 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.79 
 
 
1428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.96 
 
 
777 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  34.2 
 
 
493 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  35.45 
 
 
469 aa  210  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.55 
 
 
612 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  34.66 
 
 
470 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  32.95 
 
 
468 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.29 
 
 
612 aa  209  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.95 
 
 
761 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.71 
 
 
659 aa  209  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6307  putative 2-ketoglutarate  30.09 
 
 
599 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.747625  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  34.72 
 
 
471 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.02 
 
 
479 aa  207  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  32.71 
 
 
468 aa  207  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.74 
 
 
465 aa  207  6e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  34.82 
 
 
469 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.04 
 
 
793 aa  205  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.99 
 
 
614 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.76 
 
 
1105 aa  204  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.94 
 
 
463 aa  203  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  34.11 
 
 
470 aa  203  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  32.09 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  31.68 
 
 
656 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.8 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.48 
 
 
608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  31.96 
 
 
468 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  34.66 
 
 
463 aa  200  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.76 
 
 
596 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.64 
 
 
609 aa  199  7.999999999999999e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  33.65 
 
 
455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  31.93 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  32.06 
 
 
1075 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  32.62 
 
 
598 aa  197  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.07 
 
 
652 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.931627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0659  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.46 
 
 
670 aa  197  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.12 
 
 
465 aa  197  6e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  33.72 
 
 
468 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5479  Glutamate synthase (NADPH)  29.22 
 
 
599 aa  196  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>