90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8678 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 288 aa  567  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 265 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  57.56 
 
 		 281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  57.49 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  48.09 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  52.94 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  45.42 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 268 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 261 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 282 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  42.63 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  44.96 
 
 		 273 aa  191  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 271 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  41.73 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 244 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  44.3 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  38.93 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  38.58 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  40.08 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  38.43 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  40.33 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  38.11 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  35.04 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  30.58 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 241 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 195 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  31.43 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  45.83 
 
 		 48 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 188 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 97 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  33.9 
 
 		 90 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 84 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 218 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 99 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1891  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 117 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00988673  normal  0.0163804 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  29.08 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 97 aa  42.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 84 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>