158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8516 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
497 aa  976    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  38.42 
 
 
380 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  33.75 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  33.17 
 
 
391 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  35.25 
 
 
395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  32.95 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  39.72 
 
 
382 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  36.45 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  37.8 
 
 
395 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  28.77 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  31.17 
 
 
443 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  39.02 
 
 
561 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  31.41 
 
 
399 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  32.44 
 
 
453 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  32.46 
 
 
431 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  33.94 
 
 
410 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  34.45 
 
 
463 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  34.78 
 
 
374 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  34.74 
 
 
412 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  29.89 
 
 
564 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  31.8 
 
 
442 aa  94.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  31.78 
 
 
375 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  32.05 
 
 
415 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  35.64 
 
 
384 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  35.15 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  26.53 
 
 
463 aa  84  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  35.12 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  32.26 
 
 
384 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  32.26 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  29.38 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  32.99 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  36.1 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  31.27 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  29.41 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  31.1 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  29.26 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  30.79 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  29.31 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  28.42 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  32.64 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  29.56 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  33.89 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  37.82 
 
 
491 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  33.62 
 
 
422 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  29.5 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  33.83 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  28.02 
 
 
450 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  28.08 
 
 
395 aa  64.7  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  28.07 
 
 
384 aa  63.5  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  29.44 
 
 
391 aa  63.5  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  33.53 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  31.98 
 
 
386 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  28.2 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  32.26 
 
 
412 aa  60.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  31.31 
 
 
325 aa  60.1  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  37.19 
 
 
428 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
552 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  33.82 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  31.91 
 
 
444 aa  57.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  29.55 
 
 
333 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  36.03 
 
 
473 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  24.4 
 
 
433 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  32.51 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  26.67 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  30.36 
 
 
448 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  31.25 
 
 
429 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  28.33 
 
 
358 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  26.39 
 
 
443 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.6 
 
 
442 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  29.09 
 
 
428 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  36.61 
 
 
370 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  30.77 
 
 
440 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.77 
 
 
426 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  23.12 
 
 
402 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  26.83 
 
 
436 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  30.58 
 
 
440 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  33.04 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  32.84 
 
 
380 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  31.41 
 
 
391 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  22.43 
 
 
446 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  26.23 
 
 
432 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  25.98 
 
 
363 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  18.1 
 
 
401 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  25.84 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  27.81 
 
 
575 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  36.94 
 
 
318 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  27.89 
 
 
398 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  35.48 
 
 
314 aa  51.2  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
444 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 
444 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.72 
 
 
458 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  26.16 
 
 
417 aa  50.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  31.64 
 
 
434 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  24.34 
 
 
372 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  36.21 
 
 
433 aa  50.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  23.94 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  31.11 
 
 
443 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  32.96 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  29.55 
 
 
453 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  40.48 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>