252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7231 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 514 aa  1024    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  50.89 
 
 		 519 aa  514  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  43.25 
 
 		 528 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  45.16 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  37.18 
 
 		 521 aa  310  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  37.12 
 
 		 527 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  34.63 
 
 		 522 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  34.14 
 
 		 518 aa  249  9e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  32.41 
 
 		 526 aa  248  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  33.27 
 
 		 510 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  30.16 
 
 		 530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  33.2 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  32.33 
 
 		 530 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  30.32 
 
 		 576 aa  209  9e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  32.09 
 
 		 522 aa  206  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  30.92 
 
 		 542 aa  204  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  27.04 
 
 		 570 aa  194  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  27.2 
 
 		 571 aa  194  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  30.66 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  26.8 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  28.31 
 
 		 570 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  32.2 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  31.05 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  28.19 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  25.69 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 		 516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  28.65 
 
 		 547 aa  180  7e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  26.22 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  28.31 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  30.9 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  26.35 
 
 		 539 aa  168  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.41 
 
 		 532 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.28 
 
 		 532 aa  156  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  27.66 
 
 		 547 aa  156  9e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  27 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  25.16 
 
 		 514 aa  150  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  25.53 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.56 
 
 		 527 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  26.2 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  24.88 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  30.51 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  24.02 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.16 
 
 		 517 aa  127  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  25.33 
 
 		 764 aa  126  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 486 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 486 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 		 486 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  27.33 
 
 		 527 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 521 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 		 539 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 		 499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  28.41 
 
 		 499 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  25.78 
 
 		 496 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  21.88 
 
 		 518 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 531 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  26.91 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  26.6 
 
 		 499 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  26.59 
 
 		 496 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 		 510 aa  95.1  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 		 562 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01702  conserved hypothetical protein  27.35 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0232307  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  26.35 
 
 		 519 aa  80.1  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  23.69 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  22.79 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  20.88 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  25.86 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  25.86 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  25.86 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  25.86 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  25.86 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.86 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.86 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 471 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  30.2 
 
 		 440 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>