130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7125 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7125  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 172 aa  344  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  53.38 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0464  MarR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 161 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 150 aa  84.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  28.89 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  20.72 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30.6 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  34.31 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2394  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.629641  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  34.07 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  30.33 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.32 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 141 aa  44.7  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  25.95 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  25.95 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  25.95 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  25.95 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  25.95 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  25.95 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  25.95 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 154 aa  44.3  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 148 aa  44.3  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  31.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2699  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170019  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 315 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  26.92 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  25.95 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  33.66 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  49.06 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  35.05 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  27.68 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 162 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 160 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  28.44 
 
 		 163 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 185 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 171 aa  42  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 160 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 143 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 148 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 159 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>