More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5193 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
752 aa  1509    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  43.21 
 
 
695 aa  428  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.42 
 
 
764 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  39 
 
 
724 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.54 
 
 
1129 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.87 
 
 
890 aa  355  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  38.78 
 
 
764 aa  349  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  36.12 
 
 
719 aa  348  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
778 aa  345  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  36.39 
 
 
1306 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 
747 aa  332  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  32.93 
 
 
808 aa  330  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  33.85 
 
 
836 aa  324  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
806 aa  323  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
806 aa  323  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  38.38 
 
 
806 aa  323  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.1 
 
 
859 aa  320  5e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  37.92 
 
 
1117 aa  320  7e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  36.75 
 
 
821 aa  319  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
1065 aa  317  7e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  33.53 
 
 
825 aa  313  7.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 
1245 aa  310  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  33.49 
 
 
822 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  34.12 
 
 
803 aa  307  6e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0345  glycosyl transferase family 51  32.09 
 
 
987 aa  301  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0145524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 
725 aa  296  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 
830 aa  290  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  36.38 
 
 
815 aa  289  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  32.5 
 
 
774 aa  288  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  32.03 
 
 
961 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 
867 aa  284  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.27 
 
 
950 aa  276  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  32.36 
 
 
978 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.91 
 
 
618 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  32.36 
 
 
712 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.63 
 
 
769 aa  267  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.67 
 
 
814 aa  263  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.45 
 
 
648 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.11 
 
 
643 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.11 
 
 
643 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  32.39 
 
 
755 aa  259  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.13 
 
 
761 aa  259  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  31.57 
 
 
727 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  33.49 
 
 
691 aa  253  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  31.58 
 
 
640 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  33.5 
 
 
838 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.91 
 
 
643 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  32.47 
 
 
625 aa  250  8e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  31.42 
 
 
727 aa  249  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.57 
 
 
761 aa  249  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  32.76 
 
 
676 aa  248  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  32.57 
 
 
768 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.55 
 
 
776 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  29.03 
 
 
642 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  32.51 
 
 
811 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  31.76 
 
 
824 aa  244  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  31.76 
 
 
824 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.57 
 
 
727 aa  243  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  32.88 
 
 
704 aa  243  9e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  32.96 
 
 
728 aa  242  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  29.39 
 
 
727 aa  242  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  32.76 
 
 
640 aa  242  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  31.66 
 
 
718 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  32.92 
 
 
714 aa  241  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  31.21 
 
 
728 aa  241  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  33.5 
 
 
677 aa  240  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  34.06 
 
 
759 aa  240  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  29.49 
 
 
642 aa  239  9e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  32.39 
 
 
759 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  31.58 
 
 
905 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  33.67 
 
 
769 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.17 
 
 
734 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 
750 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  31.97 
 
 
739 aa  238  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  30.63 
 
 
708 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
979 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  31.56 
 
 
710 aa  237  6e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  32.29 
 
 
892 aa  237  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  32.21 
 
 
765 aa  237  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  32.81 
 
 
680 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.74 
 
 
661 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  32.54 
 
 
757 aa  235  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  32.89 
 
 
758 aa  234  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  31.44 
 
 
714 aa  234  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.13 
 
 
806 aa  234  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  31.15 
 
 
679 aa  233  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  31.8 
 
 
742 aa  233  9e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  29.11 
 
 
655 aa  233  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  30.92 
 
 
760 aa  233  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.5 
 
 
751 aa  233  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  30.68 
 
 
645 aa  233  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  31.36 
 
 
658 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
975 aa  232  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  31.6 
 
 
750 aa  232  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  30.38 
 
 
667 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  30.52 
 
 
704 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  31.55 
 
 
712 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  32.39 
 
 
707 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  29.81 
 
 
739 aa  231  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  29.53 
 
 
649 aa  231  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>