101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1859 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 269 aa  530  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  69.71 
 
 		 268 aa  318  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  71.25 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  68.46 
 
 		 274 aa  314  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  73.16 
 
 		 263 aa  304  8.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  66.39 
 
 		 246 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  68.33 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  62.5 
 
 		 254 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  66.81 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  66.67 
 
 		 272 aa  289  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  58.82 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  53.91 
 
 		 233 aa  228  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  51.46 
 
 		 263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  52.86 
 
 		 232 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  48.55 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  50.23 
 
 		 230 aa  203  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  43.75 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  41.96 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  40.54 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  41.57 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  47.6 
 
 		 372 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  42.06 
 
 		 288 aa  171  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  39.04 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  41.05 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  41.05 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  34.54 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 		 258 aa  95.5  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  31.62 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  33.62 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  34.6 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  29.44 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  35.29 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  34.58 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  32.79 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  31.88 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  31.98 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  29.69 
 
 		 254 aa  85.9  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  29.46 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  30.43 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  30.04 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  34.14 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  34.14 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  29.53 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  32.03 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  29.15 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  26.29 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  28.14 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  26.48 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  30.7 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  28.14 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  26.2 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  24.77 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  24.77 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  24.77 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  24.77 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  24.77 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  24.77 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  24.77 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  24.77 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  24.77 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  24.77 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  25.16 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  25.97 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  28.03 
 
 		 220 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  26.84 
 
 		 220 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  28.05 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  25.64 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  28 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  31.62 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  25.64 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  29.18 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  32.31 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  25.93 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  24.67 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1959  putative phage shock protein A, PspA  29.87 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0840025  normal  0.0378156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2298  phage shock protein A, PspA  29.87 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  26.32 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  29.49 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  26.2 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  28.88 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  25.79 
 
 		 222 aa  48.9  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  27.21 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1204  phage shock protein A, PspA  27.27 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  24.68 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  30.77 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  32.33 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  34.09 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1270  phage shock protein A, PspA  30.06 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1542  phage shock protein A  24.36 
 
 		 237 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  28.67 
 
 		 221 aa  46.2  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  27.67 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  29.75 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  30.87 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  30.87 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5260  phage shock protein A, PspA  30.06 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0073418  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1822  phage shock protein A  24.36 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  33.93 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  26.78 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  27.33 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  29.37 
 
 		 221 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>