More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4620 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  40.1 
 
 		 1024 aa  821    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1052 aa  2117    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  37.2 
 
 		 1038 aa  753    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  57.99 
 
 		 1039 aa  1177    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  58.55 
 
 		 1044 aa  1185    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  59.02 
 
 		 1042 aa  1220    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.5 
 
 		 1025 aa  670    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.43 
 
 		 1032 aa  765    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  48.84 
 
 		 1069 aa  1024    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  60.47 
 
 		 1038 aa  1220    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  58.99 
 
 		 1034 aa  1193    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  46.51 
 
 		 1068 aa  964    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  65.28 
 
 		 1045 aa  1394    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  43.83 
 
 		 1057 aa  878    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  51.45 
 
 		 1041 aa  1021    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  53.01 
 
 		 1048 aa  1053    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  42.36 
 
 		 1067 aa  803    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  50.3 
 
 		 1033 aa  944    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 		 1092 aa  581  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  34.55 
 
 		 1043 aa  551  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1146 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  29.4 
 
 		 1191 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  30.22 
 
 		 1165 aa  445  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  44.62 
 
 		 1189 aa  444  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  29.98 
 
 		 1134 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1143 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  43.52 
 
 		 1267 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  43.72 
 
 		 1335 aa  422  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1124 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1050 aa  353  5.9999999999999994e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1006 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 		 1034 aa  340  5.9999999999999996e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1011 aa  336  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1032 aa  333  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 1496 aa  330  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1030 aa  327  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.27 
 
 		 1022 aa  327  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1041 aa  324  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1470 aa  324  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 		 1039 aa  324  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1038 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1034 aa  319  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 		 1044 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1034 aa  317  9e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  36.88 
 
 		 1290 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1020 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1046 aa  312  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1028 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1050 aa  309  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1041 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1031 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.33 
 
 		 1024 aa  308  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1028 aa  307  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1043 aa  307  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1040 aa  306  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.52 
 
 		 1036 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1038 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1074 aa  305  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1043 aa  305  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1038 aa  305  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.63 
 
 		 1049 aa  303  8.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  26.12 
 
 		 1052 aa  303  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1026 aa  300  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1055 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1022 aa  298  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1034 aa  298  4e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1044 aa  298  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1062 aa  297  9e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1047 aa  297  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1033 aa  296  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 		 1063 aa  295  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  25.21 
 
 		 1028 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1063 aa  294  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1063 aa  294  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1045 aa  293  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1063 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1063 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1048 aa  292  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.43 
 
 		 1024 aa  292  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.45 
 
 		 1034 aa  291  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1067 aa  292  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1101 aa  291  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1042 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.27 
 
 		 1067 aa  291  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1036 aa  290  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1031 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1031 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1031 aa  288  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1044 aa  287  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1031 aa  287  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  24.88 
 
 		 1044 aa  287  9e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  24.32 
 
 		 1058 aa  287  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1071 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  25.09 
 
 		 1067 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 		 1028 aa  285  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1171 aa  285  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  24.79 
 
 		 1055 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1067 aa  283  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25 
 
 		 1041 aa  283  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  24.73 
 
 		 1031 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>