More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0745 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  37.79 
 
 		 1019 aa  664    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1027 aa  2090    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.83 
 
 		 1019 aa  681    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04840  acriflavin resistance protein  36.38 
 
 		 1018 aa  703    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  38.33 
 
 		 1025 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  48.48 
 
 		 1029 aa  971    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  67.55 
 
 		 1022 aa  1438    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  36.52 
 
 		 1027 aa  696    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.33 
 
 		 1010 aa  609  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  32.97 
 
 		 1015 aa  605  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  32.58 
 
 		 1025 aa  588  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1056 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.96 
 
 		 1016 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1036 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1040 aa  562  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.78 
 
 		 1032 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  31.46 
 
 		 1036 aa  558  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 		 1013 aa  557  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1012 aa  556  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 		 1019 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1019 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1021 aa  552  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  32.45 
 
 		 1020 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  32.79 
 
 		 1017 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  31.05 
 
 		 1019 aa  549  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  31.22 
 
 		 1013 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  30.53 
 
 		 1039 aa  538  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  31.33 
 
 		 1028 aa  537  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1025 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.79 
 
 		 1028 aa  536  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  30.93 
 
 		 1015 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1048 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1050 aa  529  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1039 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1024 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1021 aa  528  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1047 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1009 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1047 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 		 1039 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1029 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1029 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1014 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  31.32 
 
 		 1015 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1029 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 		 1016 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1042 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1029 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  31.07 
 
 		 1047 aa  522  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1029 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1029 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1027 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  31.02 
 
 		 1015 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1027 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1050 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1049 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1048 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1049 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1023 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1031 aa  515  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  30.41 
 
 		 1045 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1053 aa  516  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  32.75 
 
 		 1014 aa  515  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1028 aa  511  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1023 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1041 aa  510  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  30.71 
 
 		 1024 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  30.37 
 
 		 1025 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1018 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1046 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  30.54 
 
 		 1027 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 		 1040 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.11 
 
 		 1033 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1033 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1036 aa  506  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1014 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1046 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1024 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 		 1067 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1023 aa  504  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1035 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1035 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1029 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1047 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1048 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1047 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  30.53 
 
 		 1057 aa  502  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  31.42 
 
 		 1017 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 		 1017 aa  499  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.75 
 
 		 1017 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  29.93 
 
 		 1024 aa  498  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1019 aa  498  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1021 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 		 1045 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1021 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1018 aa  499  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 		 1044 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  30.19 
 
 		 1025 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  30.19 
 
 		 1025 aa  499  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1035 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>