More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0948 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  96.75 
 
 		 2638 aa  1207    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 752 aa  1522    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  30.58 
 
 		 528 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  30.58 
 
 		 528 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  30.3 
 
 		 533 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.01 
 
 		 1891 aa  196  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  30.2 
 
 		 511 aa  183  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.45 
 
 		 510 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  33.59 
 
 		 1021 aa  180  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  28.74 
 
 		 690 aa  173  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  29.6 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  30.88 
 
 		 599 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  29.21 
 
 		 609 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  29.28 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  30.83 
 
 		 686 aa  168  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  30.75 
 
 		 686 aa  167  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  25.67 
 
 		 694 aa  167  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  26.89 
 
 		 836 aa  166  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  29.09 
 
 		 589 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  30.16 
 
 		 687 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  28.95 
 
 		 687 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  28.95 
 
 		 687 aa  165  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  28.69 
 
 		 687 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  27.02 
 
 		 610 aa  160  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  28.35 
 
 		 574 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  32.83 
 
 		 462 aa  158  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  28.57 
 
 		 688 aa  158  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.11 
 
 		 1855 aa  157  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  27.33 
 
 		 588 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  26.46 
 
 		 586 aa  154  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25.98 
 
 		 604 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  29.44 
 
 		 600 aa  154  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 582 aa  154  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  28.02 
 
 		 676 aa  154  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.71 
 
 		 2068 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  27.69 
 
 		 675 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  24.38 
 
 		 1847 aa  151  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.96 
 
 		 1975 aa  150  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  27.5 
 
 		 675 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  27.5 
 
 		 675 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  29.14 
 
 		 1942 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 925 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  31.3 
 
 		 477 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  28.27 
 
 		 676 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  27.77 
 
 		 675 aa  148  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  27.31 
 
 		 675 aa  147  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 		 631 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.3 
 
 		 814 aa  146  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  30.31 
 
 		 524 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  29.18 
 
 		 587 aa  144  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  30.43 
 
 		 620 aa  144  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  27.54 
 
 		 676 aa  144  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  27.54 
 
 		 676 aa  144  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 676 aa  144  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  27.54 
 
 		 676 aa  144  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  28.98 
 
 		 574 aa  144  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  27.54 
 
 		 676 aa  144  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26 
 
 		 586 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  27.03 
 
 		 622 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  29.89 
 
 		 559 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  30.45 
 
 		 490 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  28.07 
 
 		 723 aa  142  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  24.65 
 
 		 586 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  27.79 
 
 		 610 aa  142  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  28.7 
 
 		 1017 aa  142  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  26.52 
 
 		 586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  26.52 
 
 		 586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  30.88 
 
 		 838 aa  141  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  26.52 
 
 		 586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  27.97 
 
 		 676 aa  141  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 		 586 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  26.32 
 
 		 586 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  28.52 
 
 		 553 aa  140  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.89 
 
 		 610 aa  140  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  24.65 
 
 		 586 aa  140  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  28.47 
 
 		 1005 aa  140  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  25.6 
 
 		 586 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  26.32 
 
 		 586 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  30.27 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  25.53 
 
 		 635 aa  138  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  27.5 
 
 		 564 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  31.32 
 
 		 703 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  28.39 
 
 		 642 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  31.23 
 
 		 532 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  29.12 
 
 		 493 aa  134  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  28.76 
 
 		 885 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  26.5 
 
 		 654 aa  132  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  26.85 
 
 		 566 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  27.31 
 
 		 515 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  26.68 
 
 		 589 aa  131  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  26.83 
 
 		 584 aa  130  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  27.82 
 
 		 586 aa  128  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  26.13 
 
 		 654 aa  127  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  24.74 
 
 		 663 aa  127  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 561 aa  127  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  26.85 
 
 		 619 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  27.37 
 
 		 649 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  24.43 
 
 		 623 aa  124  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  28.11 
 
 		 576 aa  124  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  28.49 
 
 		 499 aa  123  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>