More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01370 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  37.94 
 
 
1667 aa  969    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  36.41 
 
 
1636 aa  960    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0930816 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  35.59 
 
 
1669 aa  771    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  100 
 
 
1705 aa  3512    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  34.2 
 
 
1611 aa  633  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.576912 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.47 
 
 
1623 aa  616  9.999999999999999e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  32.52 
 
 
1135 aa  613  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.62 
 
 
1514 aa  608  9.999999999999999e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  30.72 
 
 
1535 aa  605  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.48 
 
 
1659 aa  598  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  32.05 
 
 
1587 aa  596  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  29.44 
 
 
1549 aa  595  1e-168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.97 
 
 
1396 aa  591  1e-167  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  31.64 
 
 
1168 aa  565  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  30.72 
 
 
1607 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  31.32 
 
 
1549 aa  562  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  31.98 
 
 
1157 aa  557  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  29.12 
 
 
1640 aa  546  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  29.41 
 
 
1573 aa  540  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  28.5 
 
 
1256 aa  527  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  29.83 
 
 
1367 aa  502  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  29.78 
 
 
1317 aa  496  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  29.37 
 
 
1381 aa  484  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  32.27 
 
 
1423 aa  480  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  32.23 
 
 
1458 aa  478  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  29.84 
 
 
1248 aa  461  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  31.58 
 
 
1513 aa  463  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  29.24 
 
 
1507 aa  446  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  28.91 
 
 
1127 aa  441  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  27.61 
 
 
1463 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  28.46 
 
 
1351 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.06 
 
 
1456 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  25.42 
 
 
1416 aa  386  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  25.75 
 
 
1557 aa  362  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  25.43 
 
 
1115 aa  334  8e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  28.9 
 
 
1562 aa  222  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  25.9 
 
 
1773 aa  190  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  29.24 
 
 
592 aa  174  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  28.5 
 
 
592 aa  173  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  27.4 
 
 
592 aa  171  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  27.67 
 
 
598 aa  165  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  28.12 
 
 
585 aa  165  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  24.09 
 
 
582 aa  161  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  25.08 
 
 
597 aa  161  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  27.12 
 
 
598 aa  160  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  27.43 
 
 
575 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  28.57 
 
 
598 aa  159  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  27.69 
 
 
600 aa  159  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  26.22 
 
 
669 aa  158  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  24.3 
 
 
1511 aa  157  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  26.58 
 
 
597 aa  157  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25 
 
 
589 aa  157  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  27.1 
 
 
602 aa  157  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  25.85 
 
 
597 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  27.21 
 
 
599 aa  156  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  28.99 
 
 
677 aa  155  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  25.79 
 
 
672 aa  154  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  28.42 
 
 
642 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  27.14 
 
 
607 aa  153  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  24.5 
 
 
620 aa  152  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  27.72 
 
 
598 aa  152  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0218  ABC transporter related  27.72 
 
 
603 aa  152  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.045822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  25.97 
 
 
734 aa  152  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.22 
 
 
641 aa  151  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  24.46 
 
 
611 aa  151  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  23.58 
 
 
742 aa  149  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.35 
 
 
765 aa  149  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  25.18 
 
 
765 aa  149  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.41 
 
 
597 aa  149  6e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  26.01 
 
 
734 aa  148  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  24.96 
 
 
741 aa  148  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  25.64 
 
 
598 aa  148  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  25.76 
 
 
594 aa  147  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.4 
 
 
639 aa  148  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.32 
 
 
619 aa  148  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  26.79 
 
 
613 aa  148  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  24.42 
 
 
603 aa  146  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  27.32 
 
 
592 aa  145  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  24.56 
 
 
631 aa  145  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  25.94 
 
 
594 aa  145  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  25.94 
 
 
663 aa  145  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  25.75 
 
 
600 aa  145  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  24.63 
 
 
620 aa  145  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  23.89 
 
 
609 aa  145  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.56 
 
 
604 aa  145  8e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  26.45 
 
 
575 aa  145  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  24.32 
 
 
618 aa  145  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  25.64 
 
 
739 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  25.14 
 
 
619 aa  144  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  26.92 
 
 
666 aa  144  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  25 
 
 
592 aa  144  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00588  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  26.43 
 
 
569 aa  144  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232531  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  25.86 
 
 
596 aa  144  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  23.57 
 
 
680 aa  144  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  26.57 
 
 
618 aa  143  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0731  ABC transporter related  25.79 
 
 
605 aa  143  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  24.59 
 
 
675 aa  143  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  25.5 
 
 
622 aa  143  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  29.09 
 
 
589 aa  143  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  27.61 
 
 
666 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>