More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2557 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
620 aa  1274    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.6 
 
 
621 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.35 
 
 
596 aa  464  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.7 
 
 
602 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  36.07 
 
 
600 aa  360  5e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  33.91 
 
 
617 aa  346  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.94 
 
 
621 aa  304  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.18 
 
 
622 aa  300  4e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.03 
 
 
627 aa  288  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.42 
 
 
636 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  32.03 
 
 
584 aa  257  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  31.66 
 
 
583 aa  254  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  32.24 
 
 
584 aa  253  9.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  32.87 
 
 
583 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  32.99 
 
 
579 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  31.49 
 
 
587 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  30.54 
 
 
585 aa  236  8e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  27.86 
 
 
607 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.72 
 
 
532 aa  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  24.08 
 
 
542 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  27.08 
 
 
547 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.82 
 
 
517 aa  152  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  24.62 
 
 
542 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.73 
 
 
566 aa  150  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.66 
 
 
544 aa  150  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.21 
 
 
518 aa  148  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  26.28 
 
 
536 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.16 
 
 
626 aa  147  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.77 
 
 
531 aa  147  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.26 
 
 
597 aa  146  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.34 
 
 
543 aa  146  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.28 
 
 
623 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.28 
 
 
623 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.48 
 
 
541 aa  144  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  25.78 
 
 
537 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.15 
 
 
628 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  33.84 
 
 
539 aa  143  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.83 
 
 
541 aa  143  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.1 
 
 
565 aa  143  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.81 
 
 
629 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.72 
 
 
621 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.85 
 
 
635 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.3 
 
 
564 aa  141  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  34.11 
 
 
536 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.4 
 
 
632 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  31.37 
 
 
552 aa  140  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.38 
 
 
548 aa  140  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.16 
 
 
581 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  32.97 
 
 
592 aa  140  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  26.57 
 
 
548 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.75 
 
 
545 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.38 
 
 
548 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  25.89 
 
 
541 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.38 
 
 
548 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.38 
 
 
548 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.38 
 
 
548 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.38 
 
 
548 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  26.7 
 
 
548 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  31.82 
 
 
543 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.27 
 
 
554 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.13 
 
 
548 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.2 
 
 
620 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.13 
 
 
548 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  26.7 
 
 
548 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  23.47 
 
 
531 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.03 
 
 
597 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  28.47 
 
 
628 aa  138  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  30.09 
 
 
553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
575 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.82 
 
 
554 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.36 
 
 
543 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.89 
 
 
548 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.89 
 
 
548 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.89 
 
 
548 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  25.1 
 
 
536 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.19 
 
 
532 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  35.92 
 
 
566 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.88 
 
 
606 aa  137  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  35.14 
 
 
616 aa  137  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  25.51 
 
 
542 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  25.72 
 
 
566 aa  136  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.5 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.63 
 
 
579 aa  136  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.28 
 
 
614 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.5 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.12 
 
 
600 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.92 
 
 
579 aa  136  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  35.14 
 
 
616 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  27.57 
 
 
545 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.5 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  25.38 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  33.48 
 
 
617 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  34.39 
 
 
624 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.19 
 
 
597 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  32.68 
 
 
543 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  26.75 
 
 
542 aa  135  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  33.94 
 
 
614 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.89 
 
 
554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.36 
 
 
578 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.64 
 
 
608 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>