280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1378 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1378  putative soluble lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 542 aa  1087    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0107  soluble lytic murein transglycosylase, putative  50.98 
 
 		 540 aa  484  1e-135  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0440  putative soluble lytic murein transglycosylase  41.91 
 
 		 545 aa  405  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00101982  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1546  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.48 
 
 		 545 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0859  soluble lytic murein transglycosylase, putative  43.05 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.509195  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0930  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.86 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0395136  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0992  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.86 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0469572  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0719  soluble lytic murein transglycosylase, SLT family  41.73 
 
 		 545 aa  373  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.273339  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0678  Lytic transglycosylase catalytic  37.86 
 
 		 547 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.906307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  37.41 
 
 		 654 aa  87.8  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  36.91 
 
 		 616 aa  85.9  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  34.13 
 
 		 647 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  39.26 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  32.34 
 
 		 715 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  38.69 
 
 		 669 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  31.87 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  29.56 
 
 		 197 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  36.88 
 
 		 721 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  36.76 
 
 		 663 aa  77  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  35.26 
 
 		 574 aa  76.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  30.81 
 
 		 720 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 660 aa  74.7  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  36.09 
 
 		 650 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  34.85 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  27.71 
 
 		 757 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 788 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  31.82 
 
 		 690 aa  73.6  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  34.07 
 
 		 672 aa  73.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  28.48 
 
 		 760 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  36.02 
 
 		 657 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 650 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 650 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  36.02 
 
 		 657 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 607 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  30.97 
 
 		 182 aa  72.4  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 650 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 661 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  26.56 
 
 		 644 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  26.56 
 
 		 641 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 644 aa  72  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  29.5 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  32.24 
 
 		 680 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  31.72 
 
 		 643 aa  70.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  31.4 
 
 		 664 aa  70.5  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  25.98 
 
 		 655 aa  70.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  31.45 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  35.61 
 
 		 650 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  35.82 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  35.82 
 
 		 649 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  29.19 
 
 		 833 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  32.58 
 
 		 700 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  34.35 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  25.72 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  31.11 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  31.74 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  30.22 
 
 		 643 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  34.03 
 
 		 716 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  30.6 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  27.62 
 
 		 774 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  31.71 
 
 		 749 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  27.62 
 
 		 776 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  33.54 
 
 		 659 aa  68.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  23.38 
 
 		 691 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  27.62 
 
 		 774 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  35.25 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 		 661 aa  67.4  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  33.73 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  32.12 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  32.21 
 
 		 590 aa  67.4  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 729 aa  67.4  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  37.23 
 
 		 693 aa  67.4  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 777 aa  67  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  30.28 
 
 		 649 aa  67  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  31.45 
 
 		 649 aa  66.6  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  34.23 
 
 		 653 aa  67  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  32.37 
 
 		 804 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.62 
 
 		 638 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  30 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  34.44 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  34.44 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  32.12 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  30.66 
 
 		 748 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  31.71 
 
 		 735 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  31.65 
 
 		 680 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  23.9 
 
 		 654 aa  65.5  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  29.41 
 
 		 677 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  27.65 
 
 		 647 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  29.58 
 
 		 645 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 709 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  34.09 
 
 		 682 aa  64.7  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  29.37 
 
 		 800 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  33.08 
 
 		 698 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  31.85 
 
 		 593 aa  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  28.68 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  25.86 
 
 		 745 aa  64.3  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  31.65 
 
 		 651 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  31.65 
 
 		 651 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>