125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0787 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  100 
 
 
655 aa  1284    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  26.85 
 
 
620 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  27.75 
 
 
737 aa  98.2  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  29.29 
 
 
789 aa  97.8  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  31.65 
 
 
728 aa  90.9  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  31.22 
 
 
728 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  30.91 
 
 
728 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  26.51 
 
 
692 aa  89  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.33 
 
 
587 aa  87.4  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.92 
 
 
588 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  21.02 
 
 
690 aa  86.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  28.74 
 
 
1228 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  29.3 
 
 
692 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  29.82 
 
 
693 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  21.89 
 
 
1219 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24 
 
 
605 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  20.97 
 
 
669 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  21.73 
 
 
1219 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  21.73 
 
 
1219 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  21.73 
 
 
1219 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  21.73 
 
 
1219 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  21.73 
 
 
1219 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  31 
 
 
693 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  21.53 
 
 
1219 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  23.08 
 
 
659 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.62 
 
 
1249 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  25.88 
 
 
1219 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  21.53 
 
 
1219 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  27.63 
 
 
674 aa  75.1  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3241  hypothetical protein  28.45 
 
 
701 aa  74.7  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424081  normal  0.24585 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  31.28 
 
 
599 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  21.17 
 
 
1219 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  29.88 
 
 
614 aa  73.9  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  30.24 
 
 
615 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  22.78 
 
 
764 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  20.37 
 
 
1219 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  33.72 
 
 
747 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  27.43 
 
 
1145 aa  70.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  28.57 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  21.87 
 
 
614 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  21.87 
 
 
614 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.51 
 
 
601 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  22.83 
 
 
648 aa  67.4  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  21.25 
 
 
652 aa  67  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  25.54 
 
 
712 aa  66.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  25.3 
 
 
712 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  24.43 
 
 
914 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  28.69 
 
 
444 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  24.38 
 
 
648 aa  65.1  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  26.4 
 
 
605 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  24.9 
 
 
496 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  29.44 
 
 
569 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  25.2 
 
 
659 aa  62.4  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  26.38 
 
 
675 aa  62  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  21.66 
 
 
626 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  23.02 
 
 
788 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  31.3 
 
 
569 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  26.25 
 
 
952 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  29.56 
 
 
1146 aa  61.6  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  29.56 
 
 
1146 aa  61.6  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  26.41 
 
 
666 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  25.46 
 
 
1164 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  20.09 
 
 
407 aa  60.8  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  28.33 
 
 
605 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  23.08 
 
 
585 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  24.79 
 
 
659 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  24.79 
 
 
659 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  30.24 
 
 
743 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  26.11 
 
 
603 aa  58.9  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  26.78 
 
 
679 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  27.78 
 
 
569 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  36.59 
 
 
585 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  33.7 
 
 
585 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  23.32 
 
 
660 aa  55.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  23.32 
 
 
660 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  23.41 
 
 
659 aa  54.3  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  34.38 
 
 
546 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  25.81 
 
 
493 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  23.89 
 
 
655 aa  54.3  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  27.92 
 
 
793 aa  53.9  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.21 
 
 
583 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  24.8 
 
 
649 aa  53.9  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  20.55 
 
 
602 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25.34 
 
 
548 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  23.46 
 
 
709 aa  53.5  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  25.12 
 
 
664 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  29.91 
 
 
632 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  46.27 
 
 
570 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  21.34 
 
 
686 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  23.27 
 
 
654 aa  52  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  21.54 
 
 
653 aa  51.2  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  29.49 
 
 
390 aa  50.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4349  hypothetical protein  22.65 
 
 
742 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4663  hypothetical protein  22.65 
 
 
742 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03980  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  22.65 
 
 
742 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  25.08 
 
 
652 aa  50.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3684  hypothetical protein  40.98 
 
 
794 aa  50.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  24.52 
 
 
551 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  23.51 
 
 
658 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03941  hypothetical protein  22.65 
 
 
742 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>