More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1963 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1963  type II secretion system protein  100 
 
 		 415 aa  840    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1232  transcription regulator AsnC  75.9 
 
 		 411 aa  650    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1011  type II secretion system protein  65.22 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1051  type II secretion system protein  64.18 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  59.52 
 
 		 413 aa  487  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1388  type II secretion system protein  45.76 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  32.95 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  30.96 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  30.56 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  30.95 
 
 		 407 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 408 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  31.5 
 
 		 411 aa  206  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  28.91 
 
 		 392 aa  203  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  30.08 
 
 		 406 aa  203  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  28.81 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 406 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 406 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  28.57 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  30.28 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  32.56 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  30.57 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  31.34 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  30.48 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  30.57 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  30 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  31.01 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  30.57 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  29.71 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  30.64 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  29.46 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  29.27 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.96 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  29.13 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 421 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  29.48 
 
 		 412 aa  189  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 422 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.23 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  30.25 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 423 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  29.34 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  26.87 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  27.3 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  29.88 
 
 		 423 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  25.65 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 406 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  27.89 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 406 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  28.61 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  25.92 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  27.34 
 
 		 419 aa  173  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 423 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  28.95 
 
 		 410 aa  172  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  25.72 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  29.32 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  26.74 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  27.16 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  27.61 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  30.45 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  28.05 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  28.05 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  28.05 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  28.05 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  27.35 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  26.18 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  26.18 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  27.05 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 423 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  26.18 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  28.53 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  27.05 
 
 		 405 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  27.94 
 
 		 406 aa  169  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  25 
 
 		 407 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  27.41 
 
 		 408 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  27.16 
 
 		 407 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 422 aa  169  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  27.25 
 
 		 407 aa  169  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  27.5 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  27.45 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  27.61 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>