146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1040 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  64.58 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  36.71 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  36.05 
 
 		 599 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  38.43 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  37.28 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  32.39 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  31.38 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  32.02 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  31.82 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  31.8 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  30.36 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  30.16 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  28.1 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  27.53 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  32.71 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  32.08 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  30.71 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  28.46 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  30.4 
 
 		 251 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  29.63 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  30.48 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  29.57 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  30.57 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  31.38 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  29.76 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  31.62 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  28.42 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  29.76 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  29.76 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  30.1 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  29.76 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  29.57 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  29.23 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  27.89 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  32.51 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.34 
 
 		 269 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  31.02 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  29.27 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  28.85 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  29.55 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  32.23 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  31.25 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  30.86 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  28.89 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  31.69 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  31.02 
 
 		 268 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  31.28 
 
 		 283 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  32.64 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  28.78 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  26.16 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  31.22 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  28.41 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  28.46 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  29.15 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  29.48 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  29.84 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  27.73 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  30.45 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  30.04 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  27.06 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  31.53 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  27.84 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  28.85 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  27.45 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.13 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  31.91 
 
 		 590 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  28.85 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0518  3-oxoacid CoA-transferase  24.32 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.77 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.79 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  25.69 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.69 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  25.69 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.39 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25.69 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25.69 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25.23 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  26.01 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1846  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.15 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.19 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  24.89 
 
 		 220 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.27 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  28.1 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.19 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.99 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.85 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  24.66 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.03 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1683  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  21.93 
 
 		 232 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0829  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.5 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.62 
 
 		 237 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.22 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2403  acetate CoA-transferase, subunit A  24.32 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.55 
 
 		 219 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.22 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2276  acetate CoA-transferase, subunit A  23.98 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0656  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  22.97 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  27.31 
 
 		 461 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>