109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0621 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  100 
 
 		 341 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  74.25 
 
 		 342 aa  512  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  47.25 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  45.4 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  43.73 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.99 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  26.8 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 372 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  26.27 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  28.81 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  27.12 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  33.87 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  27.94 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  27.58 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  26.3 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  27.73 
 
 		 349 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  28.47 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  25.41 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  25.96 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  23.84 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  26.72 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.3 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  26.59 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.27 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  25.47 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  25.92 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.72 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  27.82 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  27.43 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  25.75 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  24.93 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  26.19 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  23.56 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  26.19 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  25 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.86 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.22 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.67 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 364 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  25.33 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  26.76 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  22.74 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  27.11 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  24.14 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.11 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  24.66 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  25.21 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.45 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  25.07 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  30.11 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  26.63 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.41 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.22 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  25.27 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  26.42 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  24.35 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  22.13 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.86 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  26.94 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  24.56 
 
 		 629 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.74 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.62 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  24.73 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  23.4 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  27.24 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  24 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  21.3 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.92 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  21.18 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>