More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3370 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3370  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3969  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1603  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  34.6 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0992  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4672  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5871  transcriptional regulator GntR family  36.62 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1750  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.271582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2086  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  27.11 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  23.81 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  26.22 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  28.19 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  22.48 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  26.41 
 
 		 235 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 203 aa  53.5  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 219 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  27.23 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 211 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  28.31 
 
 		 229 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 224 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 237 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 227 aa  52.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 237 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 244 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05438  transcription regulator protein  26.21 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.185679  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  40.23 
 
 		 236 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  45.45 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 234 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 233 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1967  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0532674  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2840  transcriptional regulator, GntR family  26.8 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7611  transcriptional regulator GntR family  35.05 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 231 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  26.42 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0778  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  25.87 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1000  transcriptional regulator, GntR family  27.3 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.801369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0060  transcriptional regulator, GntR family  23.88 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  27.57 
 
 		 205 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 229 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  26.8 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 227 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 242 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 234 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 227 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  40 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 217 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 		 232 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 231 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  40.32 
 
 		 229 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 211 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  28.14 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 222 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>