More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1932 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  95.87 
 
 		 837 aa  1643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  42.86 
 
 		 845 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 918 aa  1898    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  73.52 
 
 		 889 aa  1193    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  43.04 
 
 		 1284 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  48.24 
 
 		 952 aa  844    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  56.43 
 
 		 840 aa  941    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  47.99 
 
 		 846 aa  765    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  50 
 
 		 912 aa  776    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  48.17 
 
 		 924 aa  741    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  44.79 
 
 		 845 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  43.56 
 
 		 1284 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  78.8 
 
 		 920 aa  1472    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  91.94 
 
 		 885 aa  1672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  41.65 
 
 		 843 aa  628  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  37.35 
 
 		 941 aa  525  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  38.88 
 
 		 826 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  36.36 
 
 		 822 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  33.67 
 
 		 886 aa  436  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  35.96 
 
 		 975 aa  432  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  34.02 
 
 		 901 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  32.94 
 
 		 855 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  32.27 
 
 		 1048 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  30.57 
 
 		 862 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  31.26 
 
 		 890 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  30.75 
 
 		 862 aa  365  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  37.99 
 
 		 724 aa  365  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  361  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  361  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  360  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  360  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  360  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  360  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  38.04 
 
 		 775 aa  360  7e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  38.53 
 
 		 676 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  34.6 
 
 		 916 aa  357  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  34.6 
 
 		 874 aa  357  5.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  37.44 
 
 		 725 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  34.6 
 
 		 922 aa  357  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  36.17 
 
 		 714 aa  345  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  31.64 
 
 		 968 aa  344  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  36.1 
 
 		 1981 aa  339  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  34.27 
 
 		 1057 aa  337  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  36.48 
 
 		 540 aa  335  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  36.75 
 
 		 729 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  35.16 
 
 		 872 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  33.93 
 
 		 729 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  29.24 
 
 		 852 aa  328  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  32.97 
 
 		 743 aa  328  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  34.98 
 
 		 896 aa  327  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  34.98 
 
 		 858 aa  327  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  34.98 
 
 		 930 aa  327  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.52 
 
 		 910 aa  324  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  31.15 
 
 		 871 aa  323  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  33.06 
 
 		 730 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  34.39 
 
 		 1048 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  34.16 
 
 		 794 aa  313  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.16 
 
 		 869 aa  310  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  30 
 
 		 843 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.01 
 
 		 875 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.04 
 
 		 1074 aa  307  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  29.97 
 
 		 853 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.69 
 
 		 1063 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.69 
 
 		 1063 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  33.88 
 
 		 731 aa  302  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  33.71 
 
 		 734 aa  301  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  33.71 
 
 		 734 aa  301  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  33.71 
 
 		 734 aa  301  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  33.71 
 
 		 731 aa  301  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  33.71 
 
 		 734 aa  301  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  33.71 
 
 		 734 aa  301  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  27.74 
 
 		 1057 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.48 
 
 		 1063 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  27.71 
 
 		 1057 aa  298  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  33.55 
 
 		 734 aa  298  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  30.96 
 
 		 834 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  30.96 
 
 		 834 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  30.96 
 
 		 834 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  28.93 
 
 		 843 aa  296  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  36.12 
 
 		 757 aa  295  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  27.62 
 
 		 1059 aa  294  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  29.53 
 
 		 923 aa  291  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 		 838 aa  288  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  35.36 
 
 		 734 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  28.66 
 
 		 853 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  35.17 
 
 		 734 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  29.51 
 
 		 853 aa  281  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  28.09 
 
 		 895 aa  277  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  27.42 
 
 		 895 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 841 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 841 aa  275  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  27.54 
 
 		 895 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 841 aa  275  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  29.45 
 
 		 850 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  27.76 
 
 		 891 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  27.54 
 
 		 895 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  27.05 
 
 		 868 aa  272  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  29.45 
 
 		 850 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  29.45 
 
 		 850 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  27.56 
 
 		 850 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>