218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1249 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 702 aa  1414    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  48.5 
 
 		 1119 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  53.28 
 
 		 578 aa  229  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  38.87 
 
 		 649 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  38.4 
 
 		 994 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1147 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  35.23 
 
 		 665 aa  116  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1437 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.11 
 
 		 1186 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  31.44 
 
 		 2145 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  36.67 
 
 		 310 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  42.86 
 
 		 404 aa  106  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.64 
 
 		 810 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 878 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1550 aa  97.8  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  34.43 
 
 		 672 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.01 
 
 		 732 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 843 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  29.62 
 
 		 825 aa  95.1  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5019  TPR repeat-containing protein  39.22 
 
 		 455 aa  94  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4815  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  31.4 
 
 		 1228 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 568 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.69 
 
 		 568 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.69 
 
 		 767 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 1215 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  28.08 
 
 		 1611 aa  84.7  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  32.68 
 
 		 725 aa  78.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 		 1105 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2442  hypothetical protein  32.7 
 
 		 762 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.01518  normal  0.0170954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.71 
 
 		 1328 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1404 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  33.48 
 
 		 1476 aa  74.3  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  30.14 
 
 		 1363 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  32.37 
 
 		 799 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 1285 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  30.08 
 
 		 1507 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.64 
 
 		 885 aa  72  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  28.4 
 
 		 1044 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1079  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 830 aa  70.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 814 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 685 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1266 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1212 aa  67.8  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  27.46 
 
 		 725 aa  67.8  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 		 991 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  25.97 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 		 997 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 924 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  26.72 
 
 		 493 aa  67  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1123 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 911 aa  66.6  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  22.92 
 
 		 1009 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.36 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.63 
 
 		 919 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1039 aa  63.9  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 3560 aa  63.9  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 444 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.73 
 
 		 875 aa  63.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  29.57 
 
 		 596 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.75 
 
 		 816 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 681 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  27.84 
 
 		 724 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 3035 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.45 
 
 		 865 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 824 aa  62  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 1060 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  25.79 
 
 		 694 aa  61.6  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.87 
 
 		 1694 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1025 aa  61.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.1 
 
 		 603 aa  60.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25 
 
 		 620 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 		 787 aa  59.7  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  26.32 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.76 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  31.9 
 
 		 977 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 4489 aa  58.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  27.78 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 909 aa  58.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 636 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.72 
 
 		 2413 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 637 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  19.92 
 
 		 573 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 620 aa  57  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 612 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 3172 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 637 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 611 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 343 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.28 
 
 		 991 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  25.2 
 
 		 680 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 750 aa  55.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  26.91 
 
 		 836 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  28.96 
 
 		 829 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 949 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 		 1114 aa  54.7  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>