More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31950 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  100 
 
 		 366 aa  744    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  54.58 
 
 		 365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  47.74 
 
 		 315 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  53 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  49.37 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  47.62 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  52.78 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.89 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  42.69 
 
 		 350 aa  256  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  44.12 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  45.89 
 
 		 324 aa  252  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  46.39 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  35 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  41.98 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  38.85 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  41.11 
 
 		 266 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  41.25 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  39.08 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  38.68 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  39.54 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.71 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  36.03 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  34.6 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  36.73 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.45 
 
 		 314 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  36.4 
 
 		 461 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  30.55 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  29.32 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  34.2 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  33.46 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.15 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.01 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  29.59 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  26.8 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5786  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  0.0214928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5410  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.21 
 
 		 367 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0005  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.21 
 
 		 367 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.0820348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6075  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 		 374 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0948503  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.96 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.2 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  28.38 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1908  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.58 
 
 		 287 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.339589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.51 
 
 		 608 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3941  60 kDa inner membrane insertion protein  41.18 
 
 		 233 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000468368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.99 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.84 
 
 		 544 aa  102  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  26.61 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.03 
 
 		 628 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3943  60 kDa inner membrane insertion protein  39.02 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0504  preprotein translocase subunit  33.17 
 
 		 198 aa  99  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  30.8 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.83 
 
 		 536 aa  98.2  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  27.74 
 
 		 628 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  29.6 
 
 		 600 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.02 
 
 		 581 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  29.15 
 
 		 330 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  29.46 
 
 		 345 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.34 
 
 		 557 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.63 
 
 		 600 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.96 
 
 		 541 aa  95.1  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.58 
 
 		 517 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.03 
 
 		 531 aa  94.7  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  26.23 
 
 		 548 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.63 
 
 		 575 aa  93.6  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  26.29 
 
 		 256 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  27.98 
 
 		 271 aa  93.2  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  29 
 
 		 217 aa  92.8  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.39 
 
 		 560 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  29.3 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27 
 
 		 249 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  29.39 
 
 		 553 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.39 
 
 		 560 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.35 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  24.89 
 
 		 255 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  31.19 
 
 		 223 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  24.37 
 
 		 255 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  24.37 
 
 		 255 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  24.37 
 
 		 255 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.38 
 
 		 518 aa  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  27.27 
 
 		 258 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.39 
 
 		 560 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  24.37 
 
 		 255 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.13 
 
 		 626 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.11 
 
 		 584 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  24.37 
 
 		 255 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.39 
 
 		 560 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.43 
 
 		 543 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.61 
 
 		 578 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.79 
 
 		 541 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  26.56 
 
 		 562 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  27 
 
 		 543 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.68 
 
 		 623 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.68 
 
 		 623 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  28.82 
 
 		 229 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  27 
 
 		 544 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.38 
 
 		 526 aa  90.1  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.03 
 
 		 595 aa  89.7  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.02 
 
 		 540 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  26.92 
 
 		 268 aa  90.1  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  24.79 
 
 		 255 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>