More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3063 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  71.98 
 
 		 509 aa  712    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3063  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 559 aa  1119    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.924929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2161  choline dehydrogenase  80.86 
 
 		 588 aa  893    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  70.42 
 
 		 545 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.08 
 
 		 536 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4412  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.57 
 
 		 509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.4 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4076  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.5 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00359507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  36.05 
 
 		 574 aa  260  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2727  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.89 
 
 		 525 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.1 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  37.1 
 
 		 553 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  35.1 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 		 550 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.38 
 
 		 539 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.39 
 
 		 551 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  36.05 
 
 		 553 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.38 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.07 
 
 		 534 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.62 
 
 		 550 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0553  choline dehydrogenase  36.52 
 
 		 566 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.08 
 
 		 544 aa  246  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  34.59 
 
 		 564 aa  246  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  33.08 
 
 		 560 aa  246  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.8 
 
 		 529 aa  246  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.51 
 
 		 551 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  35.36 
 
 		 534 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5100  choline dehydrogenase  35.77 
 
 		 566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6705  choline dehydrogenase  38.81 
 
 		 516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3268  choline dehydrogenase  35.77 
 
 		 566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5182  choline dehydrogenase  35.77 
 
 		 566 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5064  choline dehydrogenase  36.13 
 
 		 565 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.96 
 
 		 551 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4867  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.64 
 
 		 560 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0401  choline dehydrogenase  36.4 
 
 		 563 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.726855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3310  choline dehydrogenase  36.26 
 
 		 572 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2554  choline dehydrogenase  35.34 
 
 		 559 aa  243  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  34.92 
 
 		 560 aa  243  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.01 
 
 		 576 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6157  choline dehydrogenase  37.13 
 
 		 561 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70940  choline dehydrogenase  36.94 
 
 		 561 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  34.59 
 
 		 565 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1035  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.51 
 
 		 609 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0728  choline dehydrogenase  34.27 
 
 		 566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  36.68 
 
 		 546 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.71 
 
 		 576 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00267  choline dehydrogenase  34.72 
 
 		 556 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4937  choline dehydrogenase  35.63 
 
 		 565 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00270  hypothetical protein  34.72 
 
 		 556 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  34.87 
 
 		 565 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  34.53 
 
 		 556 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0326  choline dehydrogenase  34.53 
 
 		 556 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5037  choline dehydrogenase  35.58 
 
 		 566 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2831  choline dehydrogenase  35.79 
 
 		 567 aa  240  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2917  choline dehydrogenase  35.79 
 
 		 567 aa  240  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.80885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3295  choline dehydrogenase  34.53 
 
 		 556 aa  239  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.08 
 
 		 574 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0342  choline dehydrogenase  34.15 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  34.34 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  34.54 
 
 		 572 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5115  choline dehydrogenase  35.26 
 
 		 565 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.08 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3312  choline dehydrogenase  34.53 
 
 		 556 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0468  choline dehydrogenase  35.58 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0914  choline dehydrogenase  35.58 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267909  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3536  choline dehydrogenase  35.58 
 
 		 566 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1072  choline dehydrogenase  35.96 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1428  choline dehydrogenase  35.58 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.783226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.37 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0179  choline dehydrogenase  35.58 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  35.69 
 
 		 570 aa  238  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0874  choline dehydrogenase  33.77 
 
 		 565 aa  238  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0481  choline dehydrogenase  35.96 
 
 		 565 aa  238  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2838  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.71 
 
 		 555 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.71 
 
 		 551 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4512  choline dehydrogenase  35.39 
 
 		 566 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0377  choline dehydrogenase  35.58 
 
 		 565 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1925  choline dehydrogenase  35.58 
 
 		 565 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0217321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1837  choline dehydrogenase  35.58 
 
 		 565 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4732  choline dehydrogenase  35.83 
 
 		 568 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1515  choline dehydrogenase  35.46 
 
 		 555 aa  236  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.307618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5244  choline dehydrogenase  35.26 
 
 		 567 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80037  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1942  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.15 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6326  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.77 
 
 		 554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  33.27 
 
 		 562 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1832  choline dehydrogenase  35.54 
 
 		 560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.287087  normal  0.448798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  36.26 
 
 		 554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  35.59 
 
 		 541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5834  choline dehydrogenase  35.1 
 
 		 577 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  33.52 
 
 		 561 aa  234  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.85 
 
 		 552 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  34.88 
 
 		 556 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2176  choline dehydrogenase  32.4 
 
 		 572 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  33.59 
 
 		 561 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  33.59 
 
 		 561 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  33.59 
 
 		 561 aa  233  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  33.59 
 
 		 561 aa  233  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1993  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.46 
 
 		 553 aa  233  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.689295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  32.53 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3372  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  35.86 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>